RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	NEK11	Q8NG66	645 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	RSC1A1	Q92681	617 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	PEBP4	Q96S96	227 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2AG1	Q9H205	316 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CARD9	Q9H257	536 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	POT1	Q9NUX5	634 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX7	Q9UNH6	387 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CHKB	Q9Y259	395 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	EPHB6	O15197	1021 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF185	O15231	689 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT86	O43790	486 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	NUAK1	O60285	661 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	MAFK	O60675	156 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	PEX11B	O96011	259 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	LDLR	P01130	860 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC172	P0C7W6	258 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	FOSL1	P15407	271 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	HCAR3	P49019	387 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	RIPPLY3	P57055	190 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	IL10RA	Q13651	578 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	DPYS	Q14117	519 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	BECN1	Q14457	450 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNAB1	Q14722	419 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	KYNU	Q16719	465 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC6A19	Q695T7	634 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	HPS6	Q86YV9	775 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	IQCK	Q8N0W5	287 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPH1	Q92598	858 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	TCTN2	Q96GX1	697 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR83	Q9NYM4	423 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM63A	O94886	807 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SPINT3	P49223	89 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK18	Q07002	472 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	MAMLD1	Q13495	774 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	RAPSN	Q13702	412 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR18	Q14330	331 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ALS2CL	Q60I27	953 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL35	Q6PF15	583 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	UBXN4	Q92575	508 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF653	Q96CK0	615 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	C19orf60	Q96EN9	201 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	FGF21	Q9NSA1	209 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71

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