RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494549.1

ACTR1A-206, Transcript of ARP1 actin related protein 1 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene ACTR1A, Length 520 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1A-206ENST00000494549 FKBPLQ9UIM3 349 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 ANAPC5Q9UJX4 755 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 APPL1Q9UKG1 709 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 A0A1W2PQM1 296 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 PPM1DO15297 605 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 STX7O15400 261 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 B4GAT1O43505 415 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 SRP72O76094 671 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 IFNB1P01574 187 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 ALPPL2P10696 532 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 ALDH3A1P30838 453 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 FOXN2P32314 431 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 MSH2P43246 934 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 SLCO1A2P46721 670 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 CLDN6P56747 220 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 CDK16Q00536 496 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 E2F1Q01094 437 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 CDH17Q12864 832 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 FOXC1Q12948 553 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 NFATC2Q13469 925 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 SETDB1Q15047 1291 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 RASA2Q15283 850 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 NR0B2Q15466 257 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 C14orf28Q4W4Y0 310 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 CMPK2Q5EBM0 449 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 ANKRD22Q5VYY1 191 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 FAM151BQ6UXP7 276 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 WASH2PQ6VEQ5 465 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 RGS9BPQ6ZS82 235 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 LINC00523Q86TU6 105 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 GKN2Q86XP6 184 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 TDRPQ86YL5 185 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 SFRP1Q8N474 314 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 FAM46DQ8NEK8 389 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 ZNF398Q8TD17 642 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 PATE1Q8WXA2 126 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 CPT1BQ92523 772 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 INPP5DQ92835 1189 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 PEX13Q92968 403 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 TMEM237Q96Q45 408 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 GSDMCQ9BYG8 508 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 OR2AG1Q9H205 316 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 WASH6PQ9NQA3 447 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 TREX1Q9NSU2 369 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 TBC1D29Q9UFV1 150 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 PADI4Q9UM07 663 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 GPR34Q9UPC5 381 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 PRKAB1Q9Y478 270 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTR1A-206ENST00000494549 PCM1Q15154 2024 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 ADAMTS20P59510 1910 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 C2orf81A6NN90 581 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 CCL22O00626 93 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 CLGNO14967 610 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 GRID2O43424 1007 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 DCTN3O75935 186 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 TMEM63AO94886 807 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 UNC5CO95185 931 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 PRAMEF1O95521 474 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 CRTAMO95727 393 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 PRSS56P0CW18 603 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 CTSEP14091 401 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 GLB1P16278 677 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 ARNTP27540 789 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 FASLGP48023 281 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 ITGA8P53708 1063 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 PDE1BQ01064 536 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 CFHR1Q03591 330 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 NAA25Q14CX7 972 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 LONRF1Q17RB8 773 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 GPR33Q49SQ1 333 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 BCL7AQ4VC05 210 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 LDLRAP1Q5SW96 308 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 AGAP9Q5VTM2 703 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 ARMC3Q5W041 872 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 IYDQ6PHW0 289 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 DOK6Q6PKX4 331 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 TAF8Q7Z7C8 310 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 GALNT13Q8IUC8 556 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTR1A-206ENST00000494549 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms