RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	MESP2	Q0VG99	397 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	AP1B1	Q10567	949 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PPP1R7	Q15435	360 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CYTH1	Q15438	398 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MST1L	Q2TV78	715 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	FUT11	Q495W5	492 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	RANBP10	Q6VN20	620 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	RAB24	Q969Q5	203 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF566	Q969W8	418 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	LRRC39	Q96DD0	335 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TBATA	Q96M53	351 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PWWP2A	Q96N64	755 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SH3GL2	Q99962	352 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	NACA2	Q9H009	215 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	BRD9	Q9H8M2	597 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	GLOD4	Q9HC38	313 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	LANCL2	Q9NS86	450 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	VPS51	Q9UID3	782 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	LRP4	O75096	1905 aa		5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	WASH3P	C4AMC7	463 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	DFFA	O00273	331 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	RIPK2	O43353	540 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TSPAN3	O60637	253 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SNAP91	O60641	907 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ERLIN1	O75477	346 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ALDH1A2	O94788	518 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TTC4	O95801	387 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	GAST	P01350	101 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	JCHAIN	P01591	159 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	RHOC	P08134	193 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CHRNB1	P11230	501 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	GCA	P28676	217 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	HOXA6	P31267	233 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	HSD17B3	P37058	310 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	OPRD1	P41143	372 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CSK	P41240	450 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	GRIA1	P42261	906 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MMP13	P45452	471 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC6A9	P48067	706 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CSNK1D	P48730	415 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	VPS41	P49754	854 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	WNT3A	P56704	352 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	GPX6	P59796	221 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TLE1	Q04724	770 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CALCOCO2	Q13137	446 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MPP3	Q13368	585 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	OLIG2	Q13516	323 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ENPP2	Q13822	863 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	DMC1	Q14565	340 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CASP8	Q14790	479 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SLMAP	Q14BN4	828 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	RASA2	Q15283	850 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	FAXC	Q5TGI0	409 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717		Q6ZVL8	140 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CYS1	Q717R9	158 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MFN1	Q8IWA4	741 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	APCDD1	Q8J025	514 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms