RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
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ATG4B-222ENST00000491867 ANKRD66B4E2M5 251 aa13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-222ENST00000491867 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.262e-7■■□□□ 13.3
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ATG4B-222ENST00000491867 CD1EP15812 388 aa13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-222ENST00000491867 TCF4P15884 667 aa13.44□□□□□ -0.26
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ATG4B-222ENST00000491867 DCDC1P59894 354 aa13.44□□□□□ -0.26
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ATG4B-222ENST00000491867 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa13.44□□□□□ -0.26
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ATG4B-222ENST00000491867 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-222ENST00000491867 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-222ENST00000491867 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-222ENST00000491867 AIPL1Q9NZN9 384 aa13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-222ENST00000491867 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
ATG4B-222ENST00000491867 E7EQ34 232 aa13.43□□□□□ -0.26
ATG4B-222ENST00000491867 PCDH17O14917 1159 aa13.43□□□□□ -0.26
ATG4B-222ENST00000491867 CBSLP0DN79 551 aa13.43□□□□□ -0.26
ATG4B-222ENST00000491867 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
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