RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490753.1

NOP56-215, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 640 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-215ENST00000490753 DTLQ9NZJ0 730 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 MAP10Q9P2G4 905 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 EPHA6Q9UF33 1036 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 RARRES3Q9UL19 164 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 PKDREJQ9NTG1 2253 aa9.5□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 MYO7BQ6PIF6 2116 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 WIPF3A6NGB9 483 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 GPR89AB7ZAQ6 455 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 CHUKO15111 745 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 DPM1O60762 260 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 MTX2O75431 263 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 CEACAM4O75871 244 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 HLA-DQB2P05538 268 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 EBLN1P0CF75 366 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 GPR89BP0CG08 455 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 RARAP10276 462 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 CA4P22748 312 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 IL4RP24394 825 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 RPL26P61254 145 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SLC7A5Q01650 507 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 GUCY2DQ02846 1103 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 NIPAL4Q0D2K0 466 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 GALNT2Q10471 571 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 NR6A1Q15406 480 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 QPCTQ16769 361 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 CERS6Q6ZMG9 384 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 LRRTM4Q86VH4 590 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ZNF547Q8IVP9 402 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 FDCSPQ8NFU4 85 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 GPR150Q8NGU9 434 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SLC35G2Q8TBE7 412 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ACTRT1Q8TDG2 376 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 EID2BQ96D98 161 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 CXorf40BQ96DE9 158 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 TRIM11Q96F44 468 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ZDHHC12Q96GR4 267 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 FCRL4Q96PJ5 515 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 TIMM29Q9BSF4 260 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 NUDT9Q9BW91 350 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SPATA16Q9BXB7 569 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 RAB33BQ9H082 229 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SLAMF7Q9NQ25 335 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SEMA5BQ9P283 1151 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SCINQ9Y6U3 715 aa9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 CCDC168Q8NDH2 2452 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 MED13LQ71F56 2210 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 PDZD2O15018 2839 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 PCNX1Q96RV3 2341 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ITPR3Q14573 2671 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 RGSL1A5PLK6 1076 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ERICH4A6NGS2 130 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 GOLGA6L10A6NI86 522 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 KMOO15229 486 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SPOPO43791 374 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SLC4A1P02730 911 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 FTLP02792 175 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 LPOP22079 712 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 LMAN1P49257 510 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 DRG2P55039 364 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 DCDC1P59894 354 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 RPS15P62841 145 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ACY1Q03154 408 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 MMRN1Q13201 1228 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 GALNT3Q14435 633 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 BOLA3Q53S33 107 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 C1QL3Q5VWW1 255 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 MAATS1Q7Z4T9 603 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 LRRC49Q8IUZ0 686 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 CCHCR1Q8TD31 782 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 TEKT4Q8WW24 435 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 GLYATL1Q969I3 302 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 PNPLA2Q96AD5 504 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 C19orf60Q96EN9 201 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 MAP3K3Q99759 626 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 RAB17Q9H0T7 212 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 TRIM39Q9HCM9 518 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 WASH6PQ9NQA3 447 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 FGF21Q9NSA1 209 aa9.48□□□□□ -0.89
NOP56-215ENST00000490753 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms