RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	MGME1	Q9BQP7	344 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344		F5H423	210 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PEX11B	O96011	259 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	EBLN1	P0CF75	366 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF30	P17039	623 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	EPHB1	P54762	984 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PPP1CA	P62136	330 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PDK1	Q15118	436 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC181	Q5TID7	509 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	BBS5	Q8N3I7	341 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	OLFM3	Q96PB7	478 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	CARD9	Q9H257	536 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	SNX7	Q9UNH6	387 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344		A0A0J9YYE9	177 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	MATN3	O15232	486 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	NUAK1	O60285	661 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	TRBC1	P01850	177 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	APOC2	P02655	101 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	CLCNKA	P51800	687 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	GNG11	P61952	73 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	GPS2	Q13227	327 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	GPR18	Q14330	331 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	KYNU	Q16719	465 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	MARC1	Q5VT66	337 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	FATE1	Q969F0	183 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	HAUS1	Q96CS2	278 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	WDR24	Q96S15	920 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	CHST8	Q9H2A9	424 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	FGF21	Q9NSA1	209 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	LRRTM2	O43300	516 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	FZD6	O60353	706 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	SCRG1	O75711	98 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	CLDN7	O95471	211 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	CXCR5	P32302	372 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	MMP13	P45452	471 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ARL4D	P49703	201 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	PER3	P56645	1201 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ACY1	Q03154	408 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	AP1B1	Q10567	949 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	XRCC4	Q13426	336 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	INSC	Q1MX18	579 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	TEX26	Q8N6G2	289 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ACTL9	Q8TC94	416 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	UBXN4	Q92575	508 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	MAML1	Q92585	1016 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	OR2AG1	Q9H205	316 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	NT5M	Q9NPB1	228 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	PCSK5	Q92824	1860 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RBM3-208	ENST00000489344	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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