RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486621.1

TTC4-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 4, human

TSL 2

Gene TTC4, Length 549 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC4-204	ENST00000486621	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	LRP4	O75096	1905 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	CAPN14	A8MX76	684 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	AREL1	O15033	823 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	CREB3	O43889	395 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	REC8	O95072	547 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	LTF	P02788	710 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	FGF5	P12034	268 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	CA5A	P35218	305 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	UBA7	P41226	1012 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	CA7	P43166	264 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	CASP5	P51878	434 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	DGKQ	P52824	942 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	RBPJ	Q06330	500 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	GTF3C1	Q12789	2109 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	GRM7	Q14831	915 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	CARD16	Q5EG05	197 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	KCTD16	Q68DU8	428 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	SCML4	Q8N228	414 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	ACBD4	Q8NC06	268 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	PATE1	Q8WXA2	126 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	C8orf76	Q96K31	380 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	RUFY1	Q96T51	708 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	JAM3	Q9BX67	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	SNX7	Q9UNH6	387 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC4-204	ENST00000486621	PRSS38	A1L453	326 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	PCDH17	O14917	1159 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	IKBKB	O14920	756 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	SNAP91	O60641	907 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	ZWINT	O95229	277 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	VNN1	O95497	513 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	IFNA2	P01563	188 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	IGHE	P01854	428 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	PCCB	P05166	539 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	CD58	P19256	250 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	FASLG	P48023	281 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	KIAA1024L	P59773	190 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	ADIG	Q0VDE8	80 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	MTM1	Q13496	603 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	NRROS	Q86YC3	692 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	GPR135	Q8IZ08	494 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTC4-204	ENST00000486621	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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