RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 FAM46DQ8NEK8 389 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 MYLIPQ8WY64 445 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 WDR92Q96MX6 357 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 VN1R3Q9BXE9 311 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 SLC17A9Q9BYT1 436 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 SAR1AQ9NR31 198 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 FOXO6A8MYZ6 492 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 K7EPI3 171 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 MRASO14807 208 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 UBOX5O94941 541 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 ASGR2P07307 311 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 NTSP30990 170 aa8.14□□□□□ -1.11
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PTPRD-211ENST00000486161 SP140Q13342 867 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 SPIDRQ14159 915 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 SLC5A9Q2M3M2 681 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
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PTPRD-211ENST00000486161 TEX26Q8N6G2 289 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGEF3Q9NR81 526 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 IL17CQ9P0M4 197 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 PSAT1Q9Y617 370 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 LINC00032P0C843 101 aa8.14□□□□□ -1.11
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PTPRD-211ENST00000486161 SGSHP51688 502 aa8.14□□□□□ -1.11
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PTPRD-211ENST00000486161 SEMA3AQ14563 771 aa8.14□□□□□ -1.11
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PTPRD-211ENST00000486161 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 SCIMPQ6UWF3 145 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 GKN2Q86XP6 184 aa8.14□□□□□ -1.11
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PTPRD-211ENST00000486161 PNPOQ9NVS9 261 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 LHX3Q9UBR4 397 aa8.14□□□□□ -1.11
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PTPRD-211ENST00000486161 DHRS7Q9Y394 339 aa8.14□□□□□ -1.11
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PTPRD-211ENST00000486161 EPHA3P29320 983 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 PPP2R1BP30154 601 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 IRF9Q00978 393 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 TCTN1Q2MV58 587 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa8.14□□□□□ -1.11
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PTPRD-211ENST00000486161 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa8.14□□□□□ -1.11
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PTPRD-211ENST00000486161 ATP6AP2O75787 350 aa8.14□□□□□ -1.11
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PTPRD-211ENST00000486161 SNX32Q86XE0 403 aa8.14□□□□□ -1.11
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PTPRD-211ENST00000486161 DKK3Q9UBP4 350 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 KCNK6Q9Y257 313 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF236Q9UL36 1845 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 AKAP10O43572 662 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 PENKP01210 267 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 IMPDH1P20839 514 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 DRD4P21917 467 aa8.13□□□□□ -1.11
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