RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 UBXN7O94888 489 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 TNFSF15O95150 251 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 VAPBO95292 243 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 SLC35G4P0C7Q5 338 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 ERVPABLB-1P60509 514 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 TMEM159Q96B96 161 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 C12orf66Q96MD2 445 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 RUNDC3BQ96NL0 473 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 CMKLR1Q99788 373 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 ASIC3Q9UHC3 531 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 BPTFQ12830 3046 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 MAGEB16A2A368 324 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 ITGA2BP08514 1039 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 OR56A5P0C7T3 313 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 TYRP1P17643 537 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 ITIH1P19827 911 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 PDHA2P29803 388 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 CASQ1P31415 396 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 RPA4Q13156 261 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 CASC4Q6P4E1 433 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 JAMLQ86YT9 394 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 SIGLEC10Q96LC7 697 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 ZMYND15Q9H091 742 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 PISDQ9UG56 409 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 CACNA1BQ00975 2339 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 C9P02748 559 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 FTH1P02794 183 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 AMD1P17707 334 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 ETV5P41161 510 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 PREPP48147 710 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 TTPAP49638 278 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 DR1Q01658 176 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 CLEC14AQ86T13 490 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 ZFPM2Q8WW38 1151 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 ELMO1Q92556 727 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 RSC1A1Q92681 617 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 THSD1Q9NS62 852 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA8KD6RF30 607 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA8TH3BQL2 631 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 JMJD7P0C870 316 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 CCL4P13236 92 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 CD151P48509 253 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 GFERP55789 205 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 SNAP47Q5SQN1 464 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 IZUMO3Q5VZ72 239 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 PCGF5Q86SE9 256 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 TMEM135Q86UB9 458 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 HOOK3Q86VS8 718 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 PLXDC1Q8IUK5 500 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 P2RY12Q9H244 342 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 SAMD15Q9P1V8 674 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 A0A087WV48 116 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 SLC5A10A0PJK1 596 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 A8MU76 341 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 TTI1O43156 1089 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 CAPZBP47756 277 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 AGBL5Q8NDL9 886 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 KRT12Q99456 494 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 CARD6Q9BX69 1037 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 RAB33BQ9H082 229 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 EPHA6Q9UF33 1036 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 KLHL3Q9UH77 587 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 SLC24A2Q9UI40 661 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-211ENST00000480301 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.44■□□□□ 0.86
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