RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 IQCHQ86VS3 1027 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 KCNMB4Q86W47 210 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PROSER1Q86XN7 944 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 RBFAQ8N0V3 343 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 OXR1Q8N573 874 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 NPWQ8N729 165 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 RDH11Q8TC12 318 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 CALML6Q8TD86 181 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 AGAP3Q96P47 875 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 IL12RB2Q99665 862 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 KIFC1Q9BW19 673 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.2□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 HMX2A2RU54 273 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 FPGTO14772 594 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 TPP1O14773 563 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 TSPAN6O43657 245 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 AP1G1O43747 822 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PLIN3O60664 434 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PIAS1O75925 651 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 COL6A2P12110 1019 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 CKMT2P17540 419 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 IGFALSP35858 605 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 RENBPP51606 427 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 RAD51Q06609 339 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 BST1Q10588 318 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ASPHQ12797 758 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 OVGP1Q12889 678 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 IRF4Q15306 451 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 DEFB133Q30KQ1 61 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ICE2Q659A1 982 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 LMNTD2Q8IXW0 634 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PAF1Q8N7H5 531 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 LMX1AQ8TE12 382 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 STON2Q8WXE9 905 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 NSL1Q96IY1 281 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 APOLD1Q96LR9 279 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ANKRD27Q96NW4 1050 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PDFQ9HBH1 243 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 NOD2Q9HC29 1040 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 GLOD4Q9HC38 313 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 HEY2Q9UBP5 337 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 AK5Q9Y6K8 562 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 KALRNO60229 2985 aa6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.18□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.18□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa6.18□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 CPED1A4D0V7 1026 aa6.18□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 TMEM114B3SHH9 223 aa6.18□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 K7ESM1 405 aa6.18□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 AGRPO00253 132 aa6.18□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 AREL1O15033 823 aa6.18□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 MUSKO15146 869 aa6.18□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 UGT1A9O60656 530 aa6.18□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 MAFKO60675 156 aa6.18□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PRAMEF11O60813 436 aa6.18□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 TM7SF2O76062 418 aa6.18□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 PCCBP05166 539 aa6.18□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 SERPINA6P08185 405 aa6.18□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 GIMD1P0DJR0 217 aa6.18□□□□□ -1.42
MITF-215ENST00000478490 ERVK-10P10266 1014 aa6.18□□□□□ -1.42
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