RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
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C9orf3-215ENST00000478473 KLHL3Q9UH77 587 aa22.88■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa22.88■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.87■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 NRDCO43847 1150 aa22.87■■□□□ 1.25
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C9orf3-215ENST00000478473 SLC35G4P0C7Q5 338 aa22.87■■□□□ 1.25
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C9orf3-215ENST00000478473 WT1P19544 449 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
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C9orf3-215ENST00000478473 SNX1Q13596 522 aa22.87■■□□□ 1.25
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C9orf3-215ENST00000478473 IL11RAQ14626 422 aa22.87■■□□□ 1.25
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C9orf3-215ENST00000478473 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa22.87■■□□□ 1.25
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C9orf3-215ENST00000478473 C12orf66Q96MD2 445 aa22.87■■□□□ 1.25
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C9orf3-215ENST00000478473 NLGN4XQ8N0W4 816 aa22.84■■□□□ 1.25
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C9orf3-215ENST00000478473 SLC12A9Q9BXP2 914 aa22.84■■□□□ 1.25
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C9orf3-215ENST00000478473 AP3B1O00203 1094 aa22.83■■□□□ 1.25
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C9orf3-215ENST00000478473 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 CYB5D1Q6P9G0 228 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 AFTPHQ6ULP2 937 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF534Q76KX8 674 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 IL22RA1Q8N6P7 574 aa22.83■■□□□ 1.25
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