RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476502.1

TRBV1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV1, Length 284 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV1-201ENST00000476502 GGNBP1Q5YKI7 109 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 TMEM198Q66K66 360 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 GPR139Q6DWJ6 353 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 KLHL35Q6PF15 583 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 RHBDF2Q6PJF5 856 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 PRSS57Q6UWY2 283 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 KRT74Q7RTS7 529 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 CUZD1Q86UP6 607 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 TEX11Q8IYF3 940 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF34Q8IZ26 560 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 ACVR1CQ8NER5 493 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 TMEM255BQ8WV15 326 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 JAKMIP2Q96AA8 810 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 ELMOD3Q96FG2 381 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 CAPNS2Q96L46 248 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 TMEM68Q96MH6 324 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF570Q96NI8 536 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 SH3GL2Q99962 352 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 TMEM30AQ9NV96 361 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 EHD2Q9NZN4 543 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 RCOR1Q9UKL0 485 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 C5P01031 1676 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 NSD3Q9BZ95 1437 aa3□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 A0A1W2PQ09 198 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 FAM170AA1A519 330 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 TTC36A6NLP5 189 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 A8MV72 311 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 FAM90A26D6RGX4 464 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 H7C0S8 307 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 JRKO75564 520 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 PRSS2P07478 247 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 SRCP12931 536 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 STX2P32856 288 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 NNMTP40261 264 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 PSMC6P62333 389 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 ECT2LQ008S8 904 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 EPS8Q12929 822 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 TMEM266Q2M3C6 531 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 BMP2KLQ5H9B9 411 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 WDR73Q6P4I2 378 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 BRAT1Q6PJG6 821 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 SARM1Q6SZW1 724 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 GFRALQ6UXV0 394 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 SLC36A4Q6YBV0 504 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 FAM47EQ6ZV65 393 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 Q75L30 129 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 VSIG1Q86XK7 387 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 NKAIN3Q8N8D7 197 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF441Q8N8Z8 693 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 HMGCLL1Q8TB92 370 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 DUSP19Q8WTR2 217 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 PIGBQ92521 554 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 SGCDQ92629 289 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 TAAR8Q969N4 342 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 CMTM3Q96MX0 182 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 PKP4Q99569 1192 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 GFI1Q99684 422 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 CSTL1Q9H114 145 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 NDST4Q9H3R1 872 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 PIGMQ9H3S5 423 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 MAGIXQ9H6Y5 334 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 KAT14Q9H8E8 782 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 EBF2Q9HAK2 575 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 SLC28A3Q9HAS3 691 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 KLHL1Q9NR64 748 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 PAG1Q9NWQ8 432 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 MCM9Q9NXL9 1143 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 COPG2Q9UBF2 871 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 FBXL17Q9UF56 701 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 SZT2Q5T011 3432 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 UBR3Q6ZT12 1888 aa2.99□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 KIF13BQ9NQT8 1826 aa2.98□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa2.98□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 C5orf60A6NFR6 353 aa2.98□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 M0QZ24 198 aa2.98□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 DAB1O75553 588 aa2.98□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 MTA2O94776 668 aa2.98□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 UGT1A1P22309 533 aa2.98□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
TRBV1-201ENST00000476502 CDH8P55286 799 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms