RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF534Q76KX8 674 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF611Q8N823 705 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC38A9Q8NBW4 561 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 IPMKQ8NFU5 416 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 BICD2Q8TD16 824 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC8CQ8TDW0 803 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC35F5Q8WV83 523 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 UROC1Q96N76 676 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 C8orf49Q96NF6 230 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC22A12Q96S37 553 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 SH2D3AQ9BRG2 576 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 C16orf70Q9BSU1 422 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 BDH2Q9BUT1 245 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 FNDC11Q9BVV2 318 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 DPAGT1Q9H3H5 408 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 SYTL2Q9HCH5 934 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 MYNNQ9NPC7 610 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 PADI2Q9Y2J8 665 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 C5orf51A6NDU8 294 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM221A6NGB7 291 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 B4DGG1 531 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 HS3ST1O14792 307 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 SPINT2O43291 252 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2T7P0C7T2 308 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 SPP1P10451 314 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 GHRP10912 638 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 AHCYP23526 432 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 SERPINB6P35237 376 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC26A5P58743 744 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 GMFBP60983 142 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 PRKCZQ05513 592 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 ST3GAL1Q11201 340 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 INAQ16352 499 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 DECR1Q16698 335 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 SMTNL2Q2TAL5 461 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 AKNAD1Q5T1N1 836 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 PRR27Q6MZM9 219 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 MFSD7Q6UXD7 560 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 SHFQ7M4L6 423 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 PIGWQ7Z7B1 504 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 EXOC3L1Q86VI1 746 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 GPSM1Q86YR5 675 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFYVE19Q96K21 471 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 P2RY12Q9H244 342 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 PARD6AQ9NPB6 346 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 CNGB3Q9NQW8 809 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 THSD1Q9NS62 852 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM45AQ9NWC5 275 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHL13Q9P2N7 655 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC17A6Q9P2U8 582 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP8B3O60423 1300 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 GRID2IPA4D2P6 1211 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 WNT9BO14905 357 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 PPIP5K2O43314 1243 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 SBK2P0C263 348 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC192P0DO97 292 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 GPD1P21695 349 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMB4P28070 264 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 LHX1P48742 406 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 UCP2P55851 309 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 GAGE2BQ13066 116 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 GAGE2EQ4V326 116 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 ASPHD1Q5U4P2 390 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 PODNL1Q6PEZ8 512 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 DLK2Q6UY11 383 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 PALB2Q86YC2 1186 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 NRROSQ86YC3 692 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 VRK3Q8IV63 474 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 SERPINA12Q8IW75 414 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 PM20D2Q8IYS1 436 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D21Q8IYX1 336 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 GCSAMQ8N6F7 178 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM163Q8TC26 289 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA1524Q8TCG1 905 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-209ENST00000473406 TAAR8Q969N4 342 aa5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms