RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465576.1

CLRN1-AS1-201, CLRN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN1-AS1, Length 2,045 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SDK1Q7Z5N4 2213 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GMNCA6NCL1 334 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SUPT3HB4E1H0 165 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TARM1B6A8C7 271 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 UBXN8O00124 270 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SCAMP1O15126 338 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 AXIN1O15169 862 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GRID2O43424 1007 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LATO43561 262 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NUAK1O60285 661 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DLX3O60479 287 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TRIM13O60858 407 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KERAO60938 352 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SUPT3HO75486 399 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CBSLP0DN79 551 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TEAD1P28347 426 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CBSP35520 551 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PREPP48147 710 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BCL7AQ4VC05 210 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TSSK4Q6SA08 328 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FRA10AC1Q70Z53 315 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CPLX4Q7Z7G2 160 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CFAP206Q8IYR0 622 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LRRC34Q8IZ02 419 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CCNYL1Q8N7R7 359 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DENND6BQ8NEG7 585 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CFAP61Q8NHU2 1237 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RDH11Q8TC12 318 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MOCOSQ96EN8 888 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SPACA7Q96KW9 195 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BMFQ96LC9 184 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EPN3Q9H201 632 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EPHX3Q9H6B9 360 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OXSMQ9NWU1 459 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GPR34Q9UPC5 381 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TTC28Q96AY4 2481 aa6.3□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KNL1Q8NG31 2342 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SYCE1LA8MT33 242 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 K7ESF4 209 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CHUKO15111 745 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LILRB5O75023 590 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SMIM24O75264 130 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GPC4O75487 556 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GUCA1CO95843 209 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CEACAM5P06731 702 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TPBGLP0DKB5 382 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GFAPP14136 432 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 AOC1P19801 751 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PDHA2P29803 388 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CCR5P51681 352 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 THOP1P52888 689 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NAGLUP54802 743 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DMWDQ09019 674 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BST1Q10588 318 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ABRQ12979 859 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 STX3Q13277 289 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NFE2L1Q14494 772 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TCEA2Q15560 299 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PFKFB4Q16877 469 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LIPMQ5VYY2 423 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ATG16L1Q676U5 607 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ENPP7Q6UWV6 458 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GCNT7Q6ZNI0 430 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 AMZ2Q86W34 360 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GPSM1Q86YR5 675 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RHEBL1Q8TAI7 183 aa6.29□□□□□ -1.4
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms