RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 PLXDC1Q8IUK5 500 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 BMPERQ8N8U9 685 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 RANBP9Q96S59 729 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 CCM2Q9BSQ5 444 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 EPB41L1Q9H4G0 881 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 COG4Q9H9E3 785 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 CHRAC1Q9NRG0 131 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF185O15231 689 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 EFSO43281 561 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 OR1I1O60431 355 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 CAPZBP47756 277 aa23.35■■□□□ 1.33
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SH3BP5-208ENST00000459627 TMPRSS3P57727 454 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 OR6P1Q8NGX9 317 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 HEXDCQ8WVB3 486 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
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SH3BP5-208ENST00000459627 ACSL5Q9ULC5 683 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 ZSCAN12O43309 604 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 RASSF9O75901 435 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 KRT14P02533 472 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 LIPCP11150 499 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 ITGB6P18564 788 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 MGAT1P26572 445 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 SH3BP2P78314 561 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM164Q5U3C3 297 aa23.34■■□□□ 1.33
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SH3BP5-208ENST00000459627 CES3Q6UWW8 571 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 GPR155Q7Z3F1 870 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 PHC3Q8NDX5 983 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 OSBPL9Q96SU4 736 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 ACSL6Q9UKU0 697 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 NMBRP28336 390 aa23.33■■□□□ 1.33
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SH3BP5-208ENST00000459627 GPS1Q13098 491 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 PCID2Q5JVF3 399 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 CACHD1Q5VU97 1274 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 ANKRD22Q5VYY1 191 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 AFTPHQ6ULP2 937 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 OR4L1Q8NH43 312 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 OR52A5Q9H2C5 316 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 HOMER3Q9NSC5 361 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 SYBUQ9NX95 663 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 SSUH2Q9Y2M2 353 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP5-208ENST00000459627 B4E171 279 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 WT1P19544 449 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
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SH3BP5-208ENST00000459627 TSPAN7P41732 249 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 ACVR1Q04771 509 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 KRT33BQ14525 404 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC81Q6ZN84 652 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 ELMO2Q96JJ3 720 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 FERD3LQ96RJ6 166 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC24A2Q9UI40 661 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 PYCARDQ9ULZ3 195 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 OR6C74A6NCV1 312 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 AVILO75366 819 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 NSG1P42857 185 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 PRAMEP78395 509 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 FOXM1Q08050 763 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 VAC14Q08AM6 782 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 ITIH4Q14624 930 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 DCAF12Q5T6F0 453 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 C4orf22Q6V702 233 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 CERS6Q6ZMG9 384 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 DTX1Q86Y01 620 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 ELMO1Q92556 727 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 PPM1MQ96MI6 270 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 DDA1Q9BW61 102 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 KIF5CO60282 957 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 AP2A2O94973 939 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 UCNP55089 124 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 LAMB3Q13751 1172 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 KCNJ11Q14654 390 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 MPP5Q8N3R9 675 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 OR4E2Q8NGC2 313 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 PDLIM2Q96JY6 352 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP5-208ENST00000459627 MAP3K3Q99759 626 aa23.3■■□□□ 1.32
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