RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBC1D3LB9A6J9 549 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LAMTOR5O43504 91 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZFPL1O95159 310 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAVIN2O95810 425 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MLYCDO95822 493 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OLFM2O95897 454 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ELANEP08246 267 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBC1D3HP0C7X1 549 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SKILP12757 684 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MMP8P22894 467 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VCPP55072 806 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00310P59036 64 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL15P61313 204 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC7A9P82251 487 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HHEXQ03014 270 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SIGLEC14Q08ET2 396 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTP4A2Q12974 167 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ASIC2Q16515 512 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VMACQ2NL98 169 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PM20D1Q6GTS8 502 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PXKQ7Z7A4 578 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPIPB3Q92617 1050 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM149B1Q96BN6 582 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AP1M1Q9BXS5 423 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBXN6Q9BZV1 441 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYNCQ9H7C4 482 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HPS4Q9NQG7 708 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARHGEF3Q9NR81 526 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COMMD8Q9NX08 183 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAB21Q9UL25 225 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHST2Q9Y4C5 530 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANTXRLA6NF34 631 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AGAP5A6NIR3 686 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SHISA7A6NL88 538 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMCO5BA8MYB1 307 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GOLGA8SH3BPF8 625 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AP3D1O14617 1153 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PI15O43692 258 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CFIP05156 583 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FYNP06241 537 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RALAP11233 206 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBL4AP11441 157 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRKCHP24723 683 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP3CCP48454 512 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CXADRP78310 365 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDR2Q01850 454 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FCHO2Q0JRZ9 810 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CBFBQ13951 182 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR6B2Q6IFH4 312 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TPRG1Q6ZUI0 275 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POLNQ7Z5Q5 900 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BBS7Q8IWZ6 715 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OLIG1Q8TAK6 271 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 P2RY11Q96G91 374 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSFY1Q96LI6 401 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPR87Q9BY21 358 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ITPAQ9BY32 194 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MFSD1Q9H3U5 465 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBC1D17Q9HA65 648 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CNGB3Q9NQW8 809 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAS2R14Q9NYV8 317 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COX16Q9P0S2 106 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSAT1Q9Y617 370 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYOFQ9NZM1 2061 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COL4A2P08572 1712 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSMD9O00233 223 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPM1DO15297 605 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHADO15335 359 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLKB1P03952 638 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GYPCP04921 128 aa8.51□□□□□ -1.05
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