RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 AGAP9Q5VTM2 703 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 METRNLQ641Q3 311 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 CRTC3Q6UUV7 619 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 WASH2PQ6VEQ5 465 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 NEK10Q6ZWH5 1172 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 DET1Q7L5Y6 550 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 LCA5Q86VQ0 697 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 NRROSQ86YC3 692 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 GALNT13Q8IUC8 556 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 HID1Q8IV36 788 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 PHACTR4Q8IZ21 702 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC22A15Q8IZD6 547 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 ZBTB2Q8N680 514 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 GPATCH11Q8N954 259 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 NETO1Q8TDF5 533 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 GPBAR1Q8TDU6 330 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 INPP5DQ92835 1189 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 TSPAN17Q96FV3 270 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 ELMO2Q96JJ3 720 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 CCM2Q9BSQ5 444 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 LRRC61Q9BV99 259 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 OR52A5Q9H2C5 316 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC68Q9H2F9 335 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 COG4Q9H9E3 785 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 CAB39LQ9H9S4 337 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 WASH6PQ9NQA3 447 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 SENP1Q9P0U3 644 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 SPASTQ9UBP0 616 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC39A10Q9ULF5 831 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM131Q92545 1883 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A096LPK6 155 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A1B0GTQ1 180 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A1W2PPM1 405 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC189A1A4V9 331 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 NEMP2A6NFY4 417 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 SMIM23A6NLE4 172 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 KPNA5O15131 536 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 TYROBPO43914 113 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 MPOP05164 745 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 MYZAPP0CAP1 466 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 JUNDP17535 347 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 ACADLP28330 430 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 GNPDA1P46926 289 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 DLG1Q12959 904 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC14A1Q13336 389 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF460Q14592 562 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 TTMPQ5BVD1 217 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 AGBL2Q5U5Z8 902 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 PAQR3Q6TCH7 311 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 CYHR1Q6ZMK1 362 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 RD3Q7Z3Z2 195 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 AMZ2Q86W34 360 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 VRK3Q8IV63 474 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKRD49Q8WVL7 239 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 ARL8AQ96BM9 186 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 CABS1Q96KC9 395 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 TSSK1BQ9BXA7 367 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM168Q9H0V1 697 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 CAAP1Q9H8G2 361 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 CYP4F12Q9HCS2 524 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 TBK1Q9UHD2 729 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 PRKAB1Q9Y478 270 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF292O60281 2723 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A087X1B8 175 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-207ENST00000454947 FOXO6A8MYZ6 492 aa9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms