RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454323.1

CUL3-208, Transcript of cullin 3, human

TSL 3

Gene CUL3, Length 688 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUL3-208	ENST00000454323	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	HM13	Q8TCT9	377 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	EXOC4	Q96A65	974 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	PREX2	Q70Z35	1606 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	STMND1	H3BQB6	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	GBA	P04062	536 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	VPREB1	P12018	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	PRF1	P14222	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	PDGFRA	P16234	1089 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	GPT	P24298	496 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	DNASE1	P24855	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	PCGF2	P35227	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	AVPR1A	P37288	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	PRKCI	P41743	596 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	PPP3CC	P48454	512 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	AMPH	P49418	695 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	LIMK1	P53667	647 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	CDH12	P55289	794 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	TMPRSS3	P57727	454 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ACSM1	Q08AH1	577 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	WASHC5	Q12768	1159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ITGA7	Q13683	1181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	KRT33B	Q14525	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	SMU1	Q2TAY7	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	KRT35	Q92764	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ZNF558	Q96NG5	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	INTS14	Q96SY0	518 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	DDO	Q99489	341 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	MMP25	Q9NPA2	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	CDH7	Q9ULB5	785 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	NFS1	Q9Y697	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	SHPRH	Q149N8	1683 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323		A0A0B4J293	547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323		A0A0G2JK05	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ZNF263	O14978	683 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	PRAMEF11	O60813	436 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ADRA2C	P18825	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	PTPN3	P26045	913 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	HSPA4	P34932	840 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	NAGLU	P54802	743 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	NEDD9	Q14511	834 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	CNPY4	Q8N129	248 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CUL3-208	ENST00000454323	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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