RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 FABP12A6NFH5 140 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 RAB36O95755 333 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ZNF20P17024 532 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 CTPS1P17812 591 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 GADD45AP24522 165 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 GHDCQ8N2G8 530 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SLC44A3Q8N4M1 653 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 C7orf57Q8NEG2 295 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 FKBP7Q9Y680 259 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 H0YGN5 161 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 BPNT1O95861 308 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 EPCAMP16422 314 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 LCP2Q13094 533 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 POM121L1PQ3SYA9 428 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 IFI44LQ53G44 452 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 P2RY11Q96G91 374 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ENY2Q9NPA8 101 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TTLL8A6PVC2 850 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 E7ENX8 843 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 M0R129 80 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 ZMPSTE24O75844 475 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 TSSK3Q96PN8 268 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 MAGEH1Q9H213 219 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 ECHDC2Q86YB7 292 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP46-201ENST00000441222 PPTC7Q8NI37 304 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 OTUB2Q96DC9 234 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.59□□□□□ -1.35
USP46-201ENST00000441222 SLC22A4Q9H015 551 aa6.59□□□□□ -1.35
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