RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RAI2Q9Y5P3 530 aa4.86□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A4D1N5 150 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A6NNC1 897 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLIC2O15247 247 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MED24O75448 989 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CREG1O75629 220 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR52Z1P0C646 297 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DANCRP0C864 163 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 G6PDP11413 515 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARSBP15848 533 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ADRA2CP18825 462 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RPL3P39023 403 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRKCZQ05513 592 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF789Q5FWF6 425 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MANEAQ5SRI9 462 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LCE1EQ5T753 118 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CNSTQ6PJW8 725 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GPR180Q86V85 440 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ADHFE1Q8IWW8 467 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RASGEF1CQ8N431 466 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TRIML1Q8N9V2 468 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PPFIBP2Q8ND30 876 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ENGASEQ8NFI3 743 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TBC1D16Q8TBP0 767 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DNASE1L2Q92874 299 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TEKT1Q969V4 418 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CABS1Q96KC9 395 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CTAGE1Q96RT6 745 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HAUS8Q9BT25 410 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ODF2LQ9ULJ1 636 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PCDHA12Q9UN75 941 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ABCC9O60706 1549 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A0G2JK05 382 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HSPA12AO43301 675 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZIC3O60481 467 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KERAO60938 352 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF217O75362 1048 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC22A3O75751 556 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RAB40ALP0C0E4 278 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 T-ENOLP0DO92 83 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MYL6BP14649 208 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NAGAP17050 411 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PIGAP37287 484 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SELENOVP59797 346 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ASIC1P78348 528 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RCN2Q14257 317 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TATDN1Q6P1N9 297 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM122CQ6P4D5 195 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC36A4Q6YBV0 504 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF534Q76KX8 674 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GPSM1Q86YR5 675 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PM20D2Q8IYS1 436 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SYCP3Q8IZU3 236 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLYBLQ8N0X4 340 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BEST3Q8N1M1 668 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC4A11Q8NBS3 891 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GPT2Q8TD30 523 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SFXN2Q96NB2 322 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR6C1Q96RD1 312 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 INTS14Q96SY0 518 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PI4K2AQ9BTU6 479 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ISCUQ9H1K1 167 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FN3KQ9H479 309 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MCM9Q9NXL9 1143 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FBXL2Q9UKC9 423 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANKUB1A6NFN9 424 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C15orf62A8K5M9 175 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF814B7Z6K7 855 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 J3QR06 171 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DVL1O14640 695 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANKRD28O15084 1053 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ATG13O75143 517 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GAGE7O76087 117 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms