RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 OR6C1Q96RD1 312 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 THAP2Q9H0W7 228 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 OR2AG1Q9H205 316 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 CARD9Q9H257 536 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 RMI1Q9H9A7 625 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 UCK1Q9HA47 277 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 ANO10Q9NW15 660 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.43□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 KATNA1O75449 491 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 CREG1O75629 220 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 UBXN7O94888 489 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 NDUFA10O95299 355 aa6.43□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 CD86P42081 329 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF165P49910 485 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 TAS2R40P59535 323 aa6.43□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 GALNT3Q14435 633 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 STX1AQ16623 288 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 CPZQ66K79 652 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.43□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 CT55Q8WUE5 264 aa6.43□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 FATE1Q969F0 183 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 TSGA13Q96PP4 275 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 TRIB3Q96RU7 358 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.43□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 PCSK5Q92824 1860 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 OR5K4A6NMS3 321 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.42□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 AURKAO14965 403 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 SEMA7AO75326 666 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 RFPL1O75677 317 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 VIPP01282 170 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 JCHAINP01591 159 aa6.42□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 CFPP27918 469 aa6.42□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 PMS2P54278 862 aa6.42□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 DNASE1L3Q13609 305 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 SEPT6Q14141 434 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 GPR18Q14330 331 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 KCNAB1Q14722 419 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 NADK2Q4G0N4 442 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 PRSS42Q7Z5A4 293 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.42□□□□□ -1.38
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