RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 BRSK1Q8TDC3 778 aa10.66□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 MAIP1Q8WWC4 291 aa10.66□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 NCSTNQ92542 709 aa10.66□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 GLYATL1Q969I3 302 aa10.66□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 MIB2Q96AX9 1013 aa10.66□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 VPS35Q96QK1 796 aa10.66□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRR14Q9BWN1 585 aa10.66□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPATA16Q9BXB7 569 aa10.66□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 LRRC40Q9H9A6 602 aa10.66□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 BPIFA1Q9NP55 256 aa10.66□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP10.66□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF148Q9UQR1 794 aa10.66□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARL5AQ9Y689 179 aa10.66□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 V9GYY5 206 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 FLNCQ14315 2725 aa10.66□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 LRRK2Q5S007 2527 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 CLEC18AA5D8T8 446 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
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APOBEC3C-202ENST00000428892 LDB2O43679 373 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 BUD23O43709 281 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 NUAK1O60285 661 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 ASMTLO95671 621 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 ETS1P14921 441 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 PSMA3P25788 255 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPL22P35268 128 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 DLSTP36957 453 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 FDFT1P37268 417 aa10.65□□□□□ -0.7
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APOBEC3C-202ENST00000428892 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 FASLGP48023 281 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 XIAPP98170 497 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 MC2RQ01718 297 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 HHEXQ03014 270 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 FOXM1Q08050 763 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 NFATC2Q13469 925 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 SEMA5AQ13591 1074 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 PTPRCAPQ14761 206 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 LONRF2Q1L5Z9 754 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 FHL5Q5TD97 284 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 LYPD8Q6UX82 237 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 CLEC18BQ6UXF7 455 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 CLEC18CQ8NCF0 446 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC37A2Q8TED4 501 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 SH3KBP1Q96B97 665 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 MS4A14Q96JA4 679 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 ULBP3Q9BZM4 244 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 RMI1Q9H9A7 625 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 ETNK1Q9HBU6 452 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRIM39Q9HCM9 518 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRDM8Q9NQV8 689 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMOXQ9NWM0 555 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.71e-6■■□□□ 12.9
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATXN10Q9UBB4 475 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 ICE1Q9Y2F5 2266 aa10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
APOBEC3C-202ENST00000428892 C2orf81A6NN90 581 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 ENO4A6NNW6 628 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 AGAP14A8MT82 685 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPR89AB7ZAQ6 455 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF185O15231 689 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPR39O43194 453 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 PSMD3O43242 534 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 IFNB1P01574 187 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPR89BP0CG08 455 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC2A4P14672 509 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 NR1D1P20393 614 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 LPOP22079 712 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 STAT5AP42229 794 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 KCNJ1P48048 391 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 SQSTM1Q13501 440 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 LRP8Q14114 963 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 ERV3-1Q14264 604 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHRNA6Q15825 494 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 CYP1B1Q16678 543 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 TTC27Q6P3X3 843 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 ASB18Q6ZVZ8 466 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC9B2Q86UD5 537 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 CREG2Q8IUH2 290 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 BMPERQ8N8U9 685 aa10.64□□□□□ -0.71
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR4K2Q8NGD2 314 aa10.64□□□□□ -0.71
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