RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 DUSP4Q13115 394 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 XYLT1Q86Y38 959 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TDRPQ86YL5 185 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 FATE1Q969F0 183 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TMCO6Q96DC7 493 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM165Q9HC07 324 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 IL1RAPQ9NPH3 570 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 NUDT4Q9NZJ9 180 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 MYPNQ86TC9 1320 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CHP2O43745 196 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CILPO75339 1184 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CDH12P55289 794 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 MPP1Q00013 466 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PEX6Q13608 980 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 UGCGQ16739 394 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 GPC2Q8N158 579 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 UBR7Q8N806 425 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 OR10A6Q8NH74 314 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR152Q8TDT2 470 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 LRTOMTQ8WZ04 291 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC115Q96NT0 180 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC25A51Q9H1U9 297 aa10.87□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ECM29Q5VYK3 1845 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC15A5A6NIM6 579 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CCNDBP1O95273 360 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 SPAM1P38567 509 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 GPD2P43304 727 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC5A3P53794 718 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 SMARCB1Q12824 385 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CHIT1Q13231 466 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TEAD4Q15561 434 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 FSTL4Q6MZW2 842 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 USP30Q70CQ3 517 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 JAZF1Q86VZ6 243 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB2Q8N680 514 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF781Q8N8C0 355 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 GBA3Q9H227 469 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 IKZF4Q9H2S9 585 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PER2O15055 1255 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 NME6O75414 186 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 PGRP06401 933 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CD2P06729 351 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 MAPK12P53778 367 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPAN5P62079 268 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 SCRN3Q0VDG4 424 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF613Q6PF04 617 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 FRMD7Q6ZUT3 714 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CADM2Q8N3J6 435 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 SVOPLQ8N434 492 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM156AQ8NDB6 213 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 GRPEL2Q8TAA5 225 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 SDCBP2Q9H190 292 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRA2Q9H9E1 313 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF4Q9NR80 690 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CNTN6Q9UQ52 1028 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TCAF1Q9Y4C2 921 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TESMINQ9Y4I5 508 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TIAM2Q8IVF5 1701 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CNTNAP1P78357 1384 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D3EA0A087X179 549 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D3LB9A6J9 549 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 DCLK1O15075 740 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D3HP0C7X1 549 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CD247P20963 164 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 IDSP22304 550 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CCNCP24863 283 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 CCL23P55773 120 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TPTEP56180 551 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TAS2R39P59534 338 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ADAM8P78325 824 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO48Q5FWF7 155 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 REP15Q6BDI9 236 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 POMZP3Q6PJE2 187 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 ARMCX6Q7L4S7 300 aa10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
EFTUD2-202ENST00000426333 FIBCD1Q8N539 461 aa10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms