RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 LRRTM4Q86VH4 590 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 PGBD3Q8N328 593 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 SPATA6LQ8N4H0 392 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 PNPLA1Q8N8W4 532 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 OR2L2Q8NH16 312 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 PTERQ96BW5 349 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 APOOQ9BUR5 198 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 CHRDQ9H2X0 955 aa9.44□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 WDR26Q9H7D7 661 aa9.44□□□□□ -0.9
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HDLBP-211ENST00000425989 DOCK9Q9BZ29 2069 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 PCM1Q15154 2024 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 TRPC5OSA6NMA1 111 aa9.43□□□□□ -0.9
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HDLBP-211ENST00000425989 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa9.43□□□□□ -0.9
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HDLBP-211ENST00000425989 FFAR2O15552 330 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 LATO43561 262 aa9.43□□□□□ -0.9
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HDLBP-211ENST00000425989 POP7O75817 140 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ATP5HO75947 161 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 SUPT7LO94864 414 aa9.43□□□□□ -0.9
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HDLBP-211ENST00000425989 CD72P21854 359 aa9.43□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
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HDLBP-211ENST00000425989 HTR1BP28222 390 aa9.43□□□□□ -0.9
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HDLBP-211ENST00000425989 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
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HDLBP-211ENST00000425989 SLC30A3Q99726 388 aa9.43□□□□□ -0.9
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HDLBP-211ENST00000425989 ANTXRLA6NF34 631 aa9.42□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 CCT8L1PA6NM43 557 aa9.42□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 GOLGA8NF8WBI6 632 aa9.42□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 H3BM21 787 aa9.42□□□□□ -0.9
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HDLBP-211ENST00000425989 SEMA4FO95754 770 aa9.42□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 BMP1P13497 986 aa9.42□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
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HDLBP-211ENST00000425989 TFF2Q03403 129 aa9.42□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 CLCQ05315 142 aa9.42□□□□□ -0.9
HDLBP-211ENST00000425989 DMPKQ09013 629 aa9.42□□□□□ -0.9
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