RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FOXP3Q9BZS1 431 aa17■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EPB41L5Q9HCM4 733 aa17■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC40A1Q9NP59 571 aa17■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa17■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ITPR1Q14643 2758 aa17■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GOLGA8KD6RF30 607 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GOLGA8TH3BQL2 631 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAD51CO43502 376 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OGNP20774 298 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCKBRP32239 447 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARL4CP56559 192 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CALCOCO2Q13137 446 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SQSTM1Q13501 440 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HIF1AQ16665 826 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TYSND1Q2T9J0 566 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BBS9Q3SYG4 887 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NEPROQ6NW34 567 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC6Q86X45 466 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPR150Q8NGU9 434 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RMDN2Q96LZ7 410 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TCF12Q99081 682 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NAT9Q9BTE0 207 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GNPTGQ9UJJ9 305 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNX24Q9Y343 169 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AK5Q9Y6K8 562 aa16.99■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC187A0A096LP49 1063 aa16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TTC4O95801 387 aa16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CSF2RBP32927 897 aa16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPL21P46778 160 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPR18Q14330 331 aa16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RTP5Q14D33 572 aa16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LONRF1Q17RB8 773 aa16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C3orf38Q5JPI3 329 aa16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHF19Q5T6S3 580 aa16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF470Q6ECI4 717 aa16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 XKR5Q6UX68 686 aa16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLITRK4Q8IW52 837 aa16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LMNTD2Q8IXW0 634 aa16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR4D9Q8NGE8 314 aa16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PANX3Q96QZ0 392 aa16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERP44Q9BS26 406 aa16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAB17Q9H0T7 212 aa16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BANF1O75531 89 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBXN7O94888 489 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AMD1P17707 334 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NDUFS1P28331 727 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PREPP48147 710 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD151P48509 253 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GABREP78334 506 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TUBB2AQ13885 445 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KRT33BQ14525 404 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CRYMQ14894 314 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLCL1Q15111 1095 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MSS51Q4VC12 460 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CILP2Q8IUL8 1156 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CALML6Q8TD86 181 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NCSTNQ92542 709 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LPGAT1Q92604 370 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM159Q96B96 161 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC39Q96DD0 335 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM167BQ9BTA0 163 aa16.97■□□□□ 0.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TUBB2BQ9BVA1 445 aa16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms