RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 ZBTB17Q13105 803 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TMED2Q15363 201 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CRY1Q16526 586 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TEX44Q53QW1 395 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 DGKKQ5KSL6 1271 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 RABGAP1LQ5R372 815 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 HECTD3Q5T447 861 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PMS2CLQ68D20 193 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CYS1Q717R9 158 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CHST9Q7L1S5 443 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 RTL10Q7L3V2 364 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 LINC00523Q86TU6 105 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 MAML1Q92585 1016 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PSMG2Q969U7 264 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TEKT5Q96M29 485 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 LRRC3BQ96PB8 259 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 IL12RB2Q99665 862 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 NACA2Q9H009 215 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 OR10A2Q9H208 303 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SEPT10Q9P0V9 454 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 DKK4Q9UBT3 224 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ZNF212Q9UDV6 495 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ASB3Q9Y575 518 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 IKBKGQ9Y6K9 419 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 HELZP42694 1942 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 DRGXA6NNA5 263 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 RASA4BC9J798 803 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 DFFAO00273 331 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PRRG1O14668 218 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PLD2O14939 933 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 RASA4O43374 803 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 RAMP2O60895 175 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 BANF1O75531 89 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ALDH1A2O94788 518 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 RHOBTB1O94844 696 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 INHBAP08476 426 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CD59P13987 128 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 GJA1P17302 382 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ENGP17813 658 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 KRT15P19012 456 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CNTFP26441 200 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 GCAP28676 217 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SSTR1P30872 391 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 MSH2P43246 934 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ABCG1P45844 678 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SERPINB9P50453 376 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 GEMP55040 296 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 DMTNQ08495 405 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CDH17Q12864 832 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PCOLCEQ15113 449 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TAF12Q16514 161 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 COLEC12Q5KU26 742 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 KCTD11Q693B1 232 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TRABD2AQ86V40 505 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 GPR135Q8IZ08 494 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 NSMCE1Q8WV22 266 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 SLC44A1Q8WWI5 657 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 PIGKQ92643 395 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CDKL2Q92772 493 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 TTC17Q96AE7 1141 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 MTBPQ96DY7 904 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CHFRQ96EP1 664 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ZFYVE19Q96K21 471 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL20-202ENST00000409189 ZNF599Q96NL3 588 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms