RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 MPC1LP0DKB6 136 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 AKT2P31751 481 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 OCRLQ01968 901 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 GBX1Q14549 363 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 KIAA0895LQ68EN5 471 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 SBSNQ6UWP8 590 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 LRRTM4Q86VH4 590 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 CRLF3Q8IUI8 442 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 CFAP206Q8IYR0 622 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 GRAMD1AQ96CP6 724 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 C7orf26Q96N11 449 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM237Q96Q45 408 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 C20orf27Q9GZN8 174 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 CDYLQ9Y232 598 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 GPC4O75487 556 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 MTHFD2P13995 350 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 CGB2Q6NT52 195 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF547Q8IVP9 402 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 GLMNQ92990 594 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 NUDT4Q9NZJ9 180 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 SLC5A10A0PJK1 596 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 POM121BA6NF01 834 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 CHUKO15111 745 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 SLCO2B1O94956 709 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 GUCA1CO95843 209 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.814e-6■□□□□ 9.4
ATG4B-204ENST00000402096 IMPDH1P20839 514 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 CCR5P51681 352 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 NFKB2Q00653 900 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 RCN2Q14257 317 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 TGFBIQ15582 683 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 SPATA21Q7Z572 469 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 SNX19Q92543 992 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 NPHS2Q9NP85 383 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 TMCO1Q9UM00 188 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 OARD1Q9Y530 152 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 H0Y8X5 98 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 GRID2O43424 1007 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 LATO43561 262 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 NDUFS2O75306 463 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 IGHV4-34P06331 123 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 GSTM1P09488 218 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 KITP10721 976 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 CXCL12P48061 93 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 HK3P52790 923 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGAP8P85298 464 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 GSTM4Q03013 218 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 ABRQ12979 859 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 NEK10Q6ZWH5 1172 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 CAMKK1Q8N5S9 505 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 OR2L2Q8NH16 312 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 CFAP61Q8NHU2 1237 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 HM13Q8TCT9 377 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 EGFL8Q99944 293 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 DRC3Q9H069 523 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 COG4Q9H9E3 785 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 INVSQ9Y283 1065 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 MGAT4DA6NG13 374 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 GPR89AB7ZAQ6 455 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 H3BM21 787 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 KMOO15229 486 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 FFAR2O15552 330 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 NPHS1O60500 1241 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 SUPT7LO94864 414 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 C8GP07360 202 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 GPR89BP0CG08 455 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 VCLP18206 1134 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 ARRB2P32121 409 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 CCR10P46092 362 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 HERVK_113P63132 956 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 PHKG1Q16816 387 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 FBXO48Q5FWF7 155 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF678Q5SXM1 525 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 PIGWQ7Z7B1 504 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 AMZ2Q86W34 360 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 BIRC7Q96CA5 298 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 L3HYPDHQ96EM0 354 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 SEC16BQ96JE7 1060 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 ERVK-6Q9BXR3 956 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM54Q9BYV2 358 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 TRIM55Q9BYV6 548 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 EBF2Q9HAK2 575 aa20.08■□□□□ 0.81
ATG4B-204ENST00000402096 TRIOO75962 3097 aa20.08■□□□□ 0.8
ATG4B-204ENST00000402096 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-204ENST00000402096 SNX3O60493 162 aa20.07■□□□□ 0.8
ATG4B-204ENST00000402096 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms