RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 GALNT5Q7Z7M9 940 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 ISCA2Q86U28 154 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCYL3Q8IZE3 742 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 NGEFQ8N5V2 710 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCFD2Q8WU76 684 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 USP6NLQ92738 828 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF653Q96CK0 615 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 LINC00479Q96M42 142 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 WDR13Q9H1Z4 485 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 C2orf42Q9NWW7 574 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 CACNG5Q9UF02 275 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 FBXL17Q9UF56 701 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRSS21Q9Y6M0 314 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 DISP3Q9P2K9 1392 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 ELOVL7A1L3X0 281 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARHGEF9O43307 516 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 CREB3O43889 395 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRMUO75648 421 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLPTM1O96005 669 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 EDN1P05305 212 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 RB1P06400 928 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACP2P11117 423 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDH8P55286 799 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 TUBB2AQ13885 445 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRT33BQ14525 404 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRT71Q3SY84 523 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 GCNT6Q5T4J0 391 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNX30Q5VWJ9 437 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAAH2Q6GMR7 532 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 CORO6Q6QEF8 472 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHST9Q7L1S5 443 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 WDTC1Q8N5D0 677 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR2T6Q8NHC8 308 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 TBC1D16Q8TBP0 767 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC47A1Q96FL8 570 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 NSL1Q96IY1 281 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM81BQ96LP2 452 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 RTP3Q9BQQ7 232 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 TUBB2BQ9BVA1 445 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 ITPAQ9BY32 194 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLA2Q9H6Q3 261 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 PAG1Q9NWQ8 432 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 RASAL2Q9UJF2 1139 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNF215Q9Y6U7 377 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A087X002 238 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 NDUFAF8A1L188 74 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 MEIOCA2RUB1 952 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 A8MZ25 164 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNM1LO00429 736 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR2C1O95371 312 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 PON1P27169 355 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 BMXP51813 675 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 SP3Q02447 781 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCNC3Q14003 757 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 DLG2Q15700 870 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC1A5Q15758 541 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC16A9Q7RTY1 509 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF554Q86TJ5 538 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF383Q8NA42 475 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRGPRDQ8TDS7 321 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 GIMAP5Q96F15 307 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 PGAM5Q96HS1 289 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 DACH2Q96NX9 599 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 MYADMQ96S97 322 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 HHATLQ9HCP6 504 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATAD3AQ9NVI7 634 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPAP1Q9NZP6 1156 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A087X0M5 115 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms