RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380003.7

C9orf72-203, Transcript of chromosome 9 open reading frame 72, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf72, Length 3,200 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72-203ENST00000380003 TUBB3Q13509 450 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 RALGPS1Q5JS13 557 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 LRRC38Q5VT99 294 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 C1orf189Q5VU69 101 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 RANBP10Q6VN20 620 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 BBS12Q6ZW61 710 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 NLGN4XQ8N0W4 816 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 LRRC57Q8N9N7 239 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 DNAAF3Q8N9W5 541 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 AVL9Q8NBF6 648 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 FCRL4Q96PJ5 515 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 FCRL5Q96RD9 977 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 FAM117AQ9C073 453 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 GBA3Q9H227 469 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 STARD5Q9NSY2 213 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 ABCA12Q86UK0 2595 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 J3QKU1 62 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 LDB2O43679 373 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 APRTP07741 180 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 RWDD2BP57060 319 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 XIAPP98170 497 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 ABRQ12979 859 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 GTF2H3Q13889 308 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 TAZQ16635 292 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 SMYD5Q6GMV2 418 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 PLXDC1Q8IUK5 500 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 KRT222Q8N1A0 295 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 OR5AR1Q8NGP9 310 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 MED8Q96G25 268 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 FERD3LQ96RJ6 166 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 SLC12A9Q9BXP2 914 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 EPN3Q9H201 632 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 FGF21Q9NSA1 209 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 GOLGA8MH3BSY2 632 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 BTN3A3O00478 584 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 FFAR3O14843 346 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 GPR42O15529 346 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 MTSS1O43312 755 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 STATHP02808 62 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 ST6GAL1P15907 406 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 LPOP22079 712 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 CES1P23141 567 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 CAPZBP47756 277 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 RPL26P61254 145 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 RHDQ02161 417 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 HSPA14Q0VDF9 509 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 IL10RAQ13651 578 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 SEMA3AQ14563 771 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 LONRF2Q1L5Z9 754 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 ZNF765Q7L2R6 523 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 SERPINA9Q86WD7 417 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 VRK3Q8IV63 474 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 WDR48Q8TAF3 677 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 IL17FQ96PD4 163 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 TBL1YQ9BQ87 522 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 MFRPQ9BY79 579 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 FAM60AQ9NP50 221 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 CHRAC1Q9NRG0 131 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 SPHK1Q9NYA1 384 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 MAP10Q9P2G4 905 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 CREBBPQ92793 2442 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 A0A0G2JNG1 304 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 PRR19A6NJB7 356 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 C2orf81A6NN90 581 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 KIR2DS3K7RE56 304 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 HGSO14964 777 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 C9P02748 559 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 FECHP22830 423 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 ADRA1AP35348 466 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 HALP42357 657 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 UQCRFS1P47985 274 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 ARL4DP49703 201 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 CCL11P51671 97 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
C9orf72-203ENST00000380003 VAV2P52735 878 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms