RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 PPP1R3BQ86XI6 285 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-202ENST00000378546 GALNT6Q8NCL4 622 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-202ENST00000378546 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-202ENST00000378546 HM13Q8TCT9 377 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-202ENST00000378546 STARD8Q92502 1023 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-202ENST00000378546 CATSPER2Q96P56 530 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-202ENST00000378546 SPRY4Q9C004 299 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-202ENST00000378546 VPS37BQ9H9H4 285 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-202ENST00000378546 ARNT2Q9HBZ2 717 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-202ENST00000378546 PDE7BQ9NP56 450 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-202ENST00000378546 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-202ENST00000378546 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa24.89■■□□□ 1.58
FAAP20-202ENST00000378546 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 NKX2-8O15522 239 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 LDB2O43679 373 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF28P17035 718 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 NELFEP18615 380 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 CCR10P46092 362 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 PRLHRP49683 370 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 GDF10P55107 478 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 MC1RQ01726 317 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 TUBB3Q13509 450 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 MAP7Q14244 749 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 GPR33Q49SQ1 333 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 C16orf46Q6P387 395 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 KLHL6Q8WZ60 621 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 RMDN2Q96LZ7 410 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 HRASLS2Q9NWW9 162 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 IL17BQ9UHF5 180 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa24.88■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 OR5K3A6NET4 321 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 PSMD3O43242 534 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 DLSTP36957 453 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 CDC20Q12834 499 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 SLC35B2Q8TB61 432 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 ATG4AQ8WYN0 398 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 HES6Q96HZ4 224 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 CD180Q99467 661 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 C19orf43Q9BQ61 176 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 CCM2Q9BSQ5 444 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 TSGA10Q9BZW7 698 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 SLC24A2Q9UI40 661 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 RARRES3Q9UL19 164 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa24.87■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 CCDC78A2IDD5 438 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 TLCD2A6NGC4 264 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 AGAP14A8MT82 685 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 GAS8O95995 478 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 TCN2P20062 427 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 NDUFS1P28331 727 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 LMAN1P49257 510 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 POLE2P56282 527 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 KCNAB1Q14722 419 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 KCTD11Q693B1 232 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 ZNF449Q6P9G9 518 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 MAP3K3Q99759 626 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 CROTQ9UKG9 612 aa24.86■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 OR6C74A6NCV1 312 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 SPAG6O75602 509 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 AP2A1O95782 977 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 CCNYL3P0C7X3 344 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 FGF5P12034 268 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 ACRV1P26436 265 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 NFKB2Q00653 900 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 ACY1Q03154 408 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 PRKAA1Q13131 559 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 LINC00523Q86TU6 105 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 SERPINA9Q86WD7 417 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 DNAAF3Q8N9W5 541 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 ADNPQ9H2P0 1102 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 STARD5Q9NSY2 213 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 SOHLH2Q9NX45 425 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 GUCA1BQ9UMX6 200 aa24.85■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 E7EVH7 732 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 SGTAO43765 313 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 IFNB1P01574 187 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 EBLN1P0CF75 366 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 CACNG1Q06432 222 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 KCNAB2Q13303 367 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 KMT5CQ86Y97 462 aa24.84■■□□□ 1.57
FAAP20-202ENST00000378546 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms