RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355560.4

CLK2-201, Transcript of CDC like kinase 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CLK2, Length 2,120 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2-201ENST00000355560 CDK15Q96Q40 435 aa25.23■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 RDH14Q9HBH5 336 aa25.23■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 WWOXQ9NZC7 414 aa25.23■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 LINC00032P0C843 101 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 UROSP10746 265 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 PSMD8P48556 350 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 GTF2H2Q13888 395 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 SULT1C3Q6IMI6 304 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 RHBDF1Q96CC6 855 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 RIPOR3Q96MK2 946 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 AIM2O14862 343 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 NUAK1O60285 661 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 OR4F21O95013 312 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 APODP05090 189 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 NUDT2P50583 147 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 CYP2U1Q7Z449 544 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 VRK3Q8IV63 474 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 ELMO1Q92556 727 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 TMEM79Q9BSE2 394 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 POLG2Q9UHN1 485 aa25.22■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 ARNTLO00327 626 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 KPNA5O15131 536 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 INPP4BO15327 924 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 CHEK2O96017 543 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 FTH1P02794 183 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 C6P13671 934 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 PKNOX1P55347 436 aa25.21■■□□□ 1.63
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CLK2-201ENST00000355560 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 DEFB107AQ8IZN7 70 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 CDYL2Q8N8U2 506 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 WDR60Q8WVS4 1066 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 TUBGCP3Q96CW5 907 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 CLDND1Q9NY35 253 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 GIMAP2Q9UG22 337 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 DENND4AQ7Z401 1863 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 SOX9P48436 509 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 ERVPABLB-1P60509 514 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 LETMD1Q6P1Q0 360 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 HMGCLL1Q8TB92 370 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 NUS1Q96E22 293 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 SLC7A8Q9UHI5 535 aa25.21■■□□□ 1.63
CLK2-201ENST00000355560 A0A088AWK7 358 aa25.2■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 QSOX1O00391 747 aa25.2■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 PEX11AO75192 247 aa25.2■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 RPIAP49247 311 aa25.2■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 GK5Q6ZS86 529 aa25.2■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 NUDT18Q6ZVK8 323 aa25.2■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa25.2■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa25.2■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 RCN3Q96D15 328 aa25.2■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 OR7A17O14581 309 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 MMP20O60882 483 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 GDF5P43026 501 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CTSCP53634 463 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CDC16Q13042 620 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CHPFQ8IZ52 775 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 UBTD2Q8WUN7 234 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 ATP6V1E2Q96A05 226 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CD244Q9BZW8 370 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 IPPKQ9H8X2 491 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 ARL15Q9NXU5 204 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 OPTCQ9UBM4 332 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 FAM8A1Q9UBU6 413 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 PDE10AQ9Y233 779 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 STON1Q9Y6Q2 735 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 SOD1P00441 154 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 C8GP07360 202 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 ANXA5P08758 320 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 MPC1LP0DKB6 136 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CCND1P24385 295 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 P2RY2P41231 377 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 WASP42768 502 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CREB5Q02930 508 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CACUL1Q86Y37 369 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 ASZ1Q8WWH4 475 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CCDC167Q9P0B6 97 aa25.19■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 TSPAN6O43657 245 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CIB2O75838 187 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 OTCP00480 354 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 PTK2BQ14289 1009 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 GRB7Q14451 532 aa25.18■■□□□ 1.62
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