RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343217.6

DUSP28-201, Transcript of dual specificity phosphatase 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene DUSP28, Length 1,555 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28-201ENST00000343217 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 ISCA2Q86U28 154 aa20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 RABEP2Q9H5N1 569 aa20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 OXSMQ9NWU1 459 aa20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 SERGEFQ9UGK8 458 aa20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 GIPC1O14908 333 aa20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 SERPINE1P05121 402 aa20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 SBK3P0C264 359 aa20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 ACADMP11310 421 aa20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 RGS4P49798 205 aa20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 STX3Q13277 289 aa20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 NEK5Q6P3R8 708 aa20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 FAM47EQ6ZV65 393 aa20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 GIMAP7Q8NHV1 300 aa20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 GALPQ9UBC7 116 aa20.51■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 TRPM6Q9BX84 2022 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 IQCF5A8MTL0 148 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 KPNA5O15131 536 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 TRIM16O95361 564 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 DGKAP23743 735 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 OXTRP30559 389 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 RPS21P63220 83 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 SHC2P98077 582 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 BST1Q10588 318 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 UAP1L1Q3KQV9 507 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 LIPMQ5VYY2 423 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 RAET1GQ6H3X3 334 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 ZBTB2Q8N680 514 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 CADM4Q8NFZ8 388 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 STAG3L4Q8TBR4 150 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 DNASE2BQ8WZ79 361 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 KIAA1191Q96A73 305 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 SLC30A3Q99726 388 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 KDM4CQ9H3R0 1056 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 PREBQ9HCU5 417 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 FSCN3Q9NQT6 498 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 THAP1Q9NVV9 213 aa20.5■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 IGLON5A6NGN9 336 aa20.49■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 ZBTB14O43829 449 aa20.49■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 SOD1P00441 154 aa20.49■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 CEACAM1P13688 526 aa20.49■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 SLC22A9Q8IVM8 553 aa20.49■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 OR14C36Q8NHC7 312 aa20.49■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 LINGO1Q96FE5 620 aa20.49■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 C7orf26Q96N11 449 aa20.49■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 GPR174Q9BXC1 333 aa20.49■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 ALG9Q9H6U8 611 aa20.49■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa20.49■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.49■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 CACNA1BQ00975 2339 aa20.49■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 ARHGAP33O14559 1287 aa20.48■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 TSPAN12O95859 305 aa20.48■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 FTH1P02794 183 aa20.48■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 CBSLP0DN79 551 aa20.48■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 CBSP35520 551 aa20.48■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 ADPRHP54922 357 aa20.48■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.48■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 PIGWQ7Z7B1 504 aa20.48■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.48■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.48■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.48■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa20.48■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa20.48■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 SUSD2Q9UGT4 822 aa20.48■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 SYCE1LA8MT33 242 aa20.47■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 DLX3O60479 287 aa20.47■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 KERAO60938 352 aa20.47■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 SMIM24O75264 130 aa20.47■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 SNNO75324 88 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 TPBGLP0DKB5 382 aa20.47■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 TEAD1P28347 426 aa20.47■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 DNAJB13P59910 316 aa20.47■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa20.47■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 PIP4P1Q86T03 277 aa20.47■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa20.47■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 PTERQ96BW5 349 aa20.47■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 TMEM114B3SHH9 223 aa20.46■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 SNX3O60493 162 aa20.46■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 TGDSO95455 350 aa20.46■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 ITGB6P18564 788 aa20.46■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 MAOBP27338 520 aa20.46■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 OCRLQ01968 901 aa20.46■□□□□ 0.87
DUSP28-201ENST00000343217 SGCGQ13326 291 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms