RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339365.2

SEC24C-201, Transcript of SEC24 homolog C, COPII coat complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SEC24C, Length 4,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF621Q6ZSS3 439 aa10.65□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 LRRC34Q8IZ02 419 aa10.65□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 NPWQ8N729 165 aa10.65□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 OR4E2Q8NGC2 313 aa10.65□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 OSER1Q9NX31 292 aa10.65□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 PRKAB1Q9Y478 270 aa10.65□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 TYRP1P17643 537 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 ATP6V1E1P36543 226 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 IL12RB1P42701 662 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 SPINT3P49223 89 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 UNC5BQ8IZJ1 945 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 SLC44A3Q8N4M1 653 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 EFCAB11Q9BUY7 163 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 ANKHQ9HCJ1 492 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 PRKAG3Q9UGI9 489 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 KCTD3Q9Y597 815 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 C5orf67F2Z3F1 127 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 PEX11AO75192 247 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 KLKB1P03952 638 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 TSPAN8P19075 237 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 NUDT2P50583 147 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 TAS2R50P59544 299 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 NEK5Q6P3R8 708 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 LILRA6Q6PI73 481 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 TMEFF1Q8IYR6 380 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 CAMKVQ8NCB2 501 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 CNDP1Q96KN2 507 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM245Q9H330 911 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 USP29Q9HBJ7 922 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 NDUFAF1Q9Y375 327 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 RAP2CQ9Y3L5 183 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 TMEM150CB9EJG8 249 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 PEX12O00623 359 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 BIRC5O15392 142 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 PRMT3O60678 531 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 JUPP14923 745 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 HNMTP50135 292 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 STC1P52823 247 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 RPL38P63173 70 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 PDK4Q16654 411 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 FUT11Q495W5 492 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF542PQ5EBM4 170 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 DCAF12L1Q5VU92 463 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 PAQR3Q6TCH7 311 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 AGAP2Q99490 1192 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 KIFC1Q9BW19 673 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 HRASLS2Q9NWW9 162 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 AK5Q9Y6K8 562 aa10.64□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 HHLA1C9JL84 531 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 BMP8BP34820 402 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 CCR8P51685 355 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 KCNJ11Q14654 390 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 FAAH2Q6GMR7 532 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 CHFRQ96EP1 664 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 LRCH3Q96II8 777 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 PLEKHA8Q96JA3 519 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 C3orf14Q9HBI5 128 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 SOX11P35716 441 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 CSNK1DP48730 415 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 PKNOX1P55347 436 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 KRT80Q6KB66 452 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 KRT73Q86Y46 540 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 KDM1BQ8NB78 822 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 NSL1Q96IY1 281 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 MRGPRX2Q96LB1 330 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 ZNF232Q9UNY5 417 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 HS3ST2Q9Y278 367 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 CCDC154A6NI56 674 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 PLK4O00444 970 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 SHBGP04278 402 aa10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 DCNP07585 359 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SEC24C-201ENST00000339365 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms