RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 GFYI3L273 518 aa15.96■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 PPP6CO00743 305 aa15.96■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 TAPBPO15533 448 aa15.96■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 ATG13O75143 517 aa15.96■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 LMNAP02545 664 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 CCND1P24385 295 aa15.96■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 POM121L1PQ3SYA9 428 aa15.96■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa15.96■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa15.96■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 SYVN1Q86TM6 617 aa15.96■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 SCUBE1Q8IWY4 988 aa15.96■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 HIST1H2ADP20671 130 aa15.95■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 PTK2BQ14289 1009 aa15.95■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 SPATA19Q7Z5L4 167 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 SFTPA1Q8IWL2 248 aa15.95■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 TRPV5Q9NQA5 729 aa15.95■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 XKR7Q5GH72 579 aa15.94■□□□□ 0.14
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HPS1-202ENST00000338546 DET1Q7L5Y6 550 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 SNX32Q86XE0 403 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 KYQ8NBH2 561 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 FBXO27Q8NI29 283 aa15.94■□□□□ 0.14
HPS1-202ENST00000338546 MCOLN3Q8TDD5 553 aa15.94■□□□□ 0.14
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