RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
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PDF-201ENST00000288022 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa24.56■■□□□ 1.52
PDF-201ENST00000288022 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa24.56■■□□□ 1.52
PDF-201ENST00000288022 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PDF-201ENST00000288022 TTI1O43156 1089 aa24.55■■□□□ 1.52
PDF-201ENST00000288022 PDHA2P29803 388 aa24.55■■□□□ 1.52
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PDF-201ENST00000288022 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
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PDF-201ENST00000288022 TGM7Q96PF1 710 aa24.55■■□□□ 1.52
PDF-201ENST00000288022 ASPMQ8IZT6 3477 aa24.54■■□□□ 1.52
PDF-201ENST00000288022 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
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PDF-201ENST00000288022 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
PDF-201ENST00000288022 CCL4P13236 92 aa24.53■■□□□ 1.52
PDF-201ENST00000288022 NDUFS1P28331 727 aa24.53■■□□□ 1.52
PDF-201ENST00000288022 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
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PDF-201ENST00000288022 CD151P48509 253 aa24.53■■□□□ 1.52
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PDF-201ENST00000288022 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa24.53■■□□□ 1.52
PDF-201ENST00000288022 PDZD3Q86UT5 571 aa24.53■■□□□ 1.52
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