RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266557.3

CD27-201, Transcript of CD27 molecule, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CD27, Length 1,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-201ENST00000266557 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.56□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 PLAAQ9Y263 795 aa14.56□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 VWA7Q9Y334 891 aa14.56□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 ASXL3Q9C0F0 2248 aa14.56□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 HMX2A2RU54 273 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 KPNA5O15131 536 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 YY2O15391 372 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 FFAR2O15552 330 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 PCDHGA12O60330 932 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 TCEA3O75764 348 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 APOA4P06727 396 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 ANXA6P08133 673 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 GIMD1P0DJR0 217 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 SAT1P21673 171 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 IDSP22304 550 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 PREPP48147 710 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 POU4F1Q01851 419 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 GBX1Q14549 363 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 METRNLQ641Q3 311 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 CD200R1Q8TD46 325 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 INPP5DQ92835 1189 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 TMEM159Q96B96 161 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 PPCSQ9HAB8 311 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 TBC1D29Q9UFV1 150 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 CDYLQ9Y232 598 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 DHRS7Q9Y394 339 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.55□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 CEP250Q9BV73 2442 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 A6NCN8 305 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 NEMP2A6NFY4 417 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 TPP1O14773 563 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 SNX2O60749 519 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 GPC4O75487 556 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 KRT38O76015 456 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 EML2O95834 649 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 CNTFP26441 200 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 SLCO1A2P46721 670 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 PGGT1BP53609 377 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 SLC12A2P55011 1212 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 RPA4Q13156 261 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 ZNF460Q14592 562 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 MROH9Q5TGP6 573 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 AGAP9Q5VTM2 703 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 LVRNQ6Q4G3 990 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 TDRPQ86YL5 185 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 FAM46DQ8NEK8 389 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 GLMNQ92990 594 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 TSPAN17Q96FV3 270 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 WWP1Q9H0M0 922 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 EURLQ9NYK6 297 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 ACSL5Q9ULC5 683 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 NFS1Q9Y697 457 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 PCNX2A6NKB5 2137 aa14.54□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 SMIM23A6NLE4 172 aa14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 B4DGG1 531 aa14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 TRIM49D1C9J1S8 452 aa14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 GFRA3O60609 400 aa14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 KRT37O76014 449 aa14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 SLCO2B1O94956 709 aa14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 SLC35G4P0C7Q5 338 aa14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 F3P13726 295 aa14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 PDHA2P29803 388 aa14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 SERPINB8P50452 374 aa14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 RASA2Q15283 850 aa14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 ACSBG2Q5FVE4 666 aa14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 PAQR3Q6TCH7 311 aa14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 WASH2PQ6VEQ5 465 aa14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 VRK3Q8IV63 474 aa14.53□□□□□ -0.08
CD27-201ENST00000266557 CEP97Q8IW35 865 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms