RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262659.12

CCM2L-201, Transcript of CCM2 like scaffold protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCM2L, Length 2,523 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2L-201ENST00000262659 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.52■■□□□ 1.36
CCM2L-201ENST00000262659 CYP3A43Q9HB55 503 aa23.52■■□□□ 1.36
CCM2L-201ENST00000262659 SMPD4Q9NXE4 827 aa23.52■■□□□ 1.36
CCM2L-201ENST00000262659 ORC6Q9Y5N6 252 aa23.52■■□□□ 1.36
CCM2L-201ENST00000262659 LTBP1Q14766 1721 aa23.52■■□□□ 1.36
CCM2L-201ENST00000262659 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 NR3C2P08235 984 aa23.52■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 AHSA2Q719I0 299 aa23.52■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 ZMIZ2Q8NF64 920 aa23.52■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 SLC35F5Q8WV83 523 aa23.52■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 SLC47A1Q96FL8 570 aa23.52■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 Q96MT0 163 aa23.52■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 RIBC2Q9H4K1 309 aa23.52■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 LIMD1Q9UGP4 676 aa23.52■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa23.52■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 OR6C70A6NIJ9 312 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 YDJCA8MPS7 323 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 A8MX80 341 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 TRAPPC2P0DI81 140 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 TRAPPC2BP0DI82 140 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 CTSKP43235 329 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 MAGEA11P43364 429 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 IL1RL1Q01638 556 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 EFR3AQ14156 821 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 PKDCCQ504Y2 493 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 CCDC190Q86UF4 302 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 EID3Q8N140 333 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 SETD9Q8NE22 299 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 CYP2S1Q96SQ9 504 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 C17orf62Q9BQA9 187 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 ACTR8Q9H981 624 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 NUP50Q9UKX7 468 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 ANK1P16157 1881 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 M0R082 166 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 CYBBP04839 570 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 PRKCBP05771 671 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 PSKH1P11801 424 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 OR5K1Q8NHB7 308 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 DEDD2Q8WXF8 326 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 TMCO6Q96DC7 493 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 CDHR1Q96JP9 859 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 NT5C1AQ9BXI3 368 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 RIPK3Q9Y572 518 aa23.51■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 AKR7A2O43488 359 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 SLC22A3O75751 556 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 ITGAMP11215 1152 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 ETV6P41212 452 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 HERVK_113P63132 956 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 RAD51Q06609 339 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 FAPQ12884 760 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 KANK2Q63ZY3 851 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 SMYD5Q6GMV2 418 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 AMIGO1Q86WK6 493 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 HPDLQ96IR7 371 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 ERVK-6Q9BXR3 956 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 IPPQ9Y573 584 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 A0A1B0GTL3 188 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 PLK4O00444 970 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 SLITRK5O94991 958 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 FGF4P08620 206 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 LCP1P13796 627 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 IL32P24001 234 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 IL12RB1P42701 662 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 HCAR3P49019 387 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 CXCR4P61073 352 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 ARMC4Q5T2S8 1044 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 CCDC32Q9BV29 185 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 TIGARQ9NQ88 270 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 KLHL20Q9Y2M5 609 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 PKP3Q9Y446 797 aa23.5■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 TSPAN1O60635 241 aa23.49■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 CYP7B1O75881 506 aa23.49■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 OR7A10O76100 309 aa23.49■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 PRKACAP17612 351 aa23.49■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 HNF4AP41235 474 aa23.49■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 PPP3CCP48454 512 aa23.49■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 PCID2Q5JVF3 399 aa23.49■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 ARHGAP17Q68EM7 881 aa23.49■■□□□ 1.35
CCM2L-201ENST00000262659 ACOT1Q86TX2 421 aa23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms