RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249700.8

TMOD2-201, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD2, Length 9,191 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-201ENST00000249700 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 UNC50Q53HI1 259 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 MIER2Q8N344 545 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 TRIML2Q8N7C3 387 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 C17orf80Q9BSJ5 609 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 ZFP14Q9HCL3 533 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 FNIP2Q9P278 1114 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 DYRK1BQ9Y463 629 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 KDELR3O43731 214 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 FGF18O76093 207 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 CDK14O94921 469 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 ITPKAP23677 461 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 RGS4P49798 205 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 HTR6P50406 440 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 PRKAA2P54646 552 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 MAGEC3Q8TD91 643 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 METTL21AQ8WXB1 218 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 TCEAL4Q96EI5 215 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 PLEKHA8Q96JA3 519 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 S100A14Q9HCY8 104 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 CROTQ9UKG9 612 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 BACE2Q9Y5Z0 518 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 E7ENX8 843 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 CAPN1P07384 714 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 MAGEA12P43365 314 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 HSPA7P48741 367 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 GRB7Q14451 532 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 AFMIDQ63HM1 303 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 GPR135Q8IZ08 494 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF599Q96NL3 588 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 SLC30A3Q99726 388 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 RTKNQ9BST9 563 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 CCL26Q9Y258 94 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 CARNS1A5YM72 827 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 HIDE1A8MVS5 230 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 PSMD8P48556 350 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 CNKSR3Q6P9H4 555 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 FBXW8Q8N3Y1 598 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 PYCR2Q96C36 320 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 C3orf30Q96M34 536 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 SEPHS2Q99611 448 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 LINC00597Q9H2U6 94 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 WASH4PA8MWX3 477 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 PER3P56645 1201 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 LMAN2Q12907 356 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 TMC5Q6UXY8 1006 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 CNTN4Q8IWV2 1026 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 OR56A4Q8NGH8 313 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 LPGAT1Q92604 370 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 ARNT2Q9HBZ2 717 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 ARL15Q9NXU5 204 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 ERVK-11Q9UQG0 969 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 SCN1AP35498 2009 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 A0A1W2PQ67 120 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 GSNP06396 782 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 NTSP30990 170 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 ATP6V0D1P61421 351 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 RPL38P63173 70 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 ARF5P84085 180 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 ALG11Q2TAA5 492 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 RFLNAQ6ZTI6 216 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 SPRED2Q7Z698 418 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 TAF8Q7Z7C8 310 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 HHIPL1Q96JK4 782 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 CCDC28BQ9BUN5 200 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 IKZF3Q9UKT9 509 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 LRCH1Q9Y2L9 728 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 H3BUI4 141 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 AQP4P55087 323 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 WDR5P61964 334 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 SH3BP2P78314 561 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 HMGCS1Q01581 520 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 DMC1Q14565 340 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 NRF1Q16656 503 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 SLC44A4Q53GD3 710 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 RNF44Q7L0R7 432 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 NUDT8Q8WV74 236 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 COPS8Q99627 209 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 CWH43Q9H720 699 aa5.97□□□□□ -1.45
TMOD2-201ENST00000249700 IPPKQ9H8X2 491 aa5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms