RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spryd7Q3TFQ1 196 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc49a3Q8CE47 516 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4932414N04RikQ8CEQ9 752 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zcchc9Q8R1J3 271 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nprl3Q8VIJ8 569 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp65Q91W94 390 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fars2Q99M01 451 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam131cA2ADB2 273 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ttll9A2APC3 461 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cilp2D3Z7H8 1162 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp4a14O35728 507 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcbp1P60335 356 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MslnQ61468 625 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fgfr3Q61851 801 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mon1aQ6PDG8 556 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cnih3Q6ZWS4 160 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam72aQ8BFZ8 149 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ofcc1Q8BGX4 166 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm6377Q8BHV4 303 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbtb6Q8K088 423 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AcadsbQ9DBL1 432 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpc6Q9R087 555 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Myo7aP97479 2215 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rad21l1A2AU37 552 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2b19O55071 492 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tdrd6P61407 2134 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pitx1P70314 315 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wbp2P97765 261 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lgals12Q91VD1 314 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Oas1cQ924S2 362 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rgs18Q99PG4 235 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abcb8Q9CXJ4 717 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PacrglQ9D3X5 248 aa15.86■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cylc1A0A1B0GR13 642 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serpine3E9Q6A2 401 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cxcl9P18340 126 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q3V0E1 1183 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem255bQ5FW56 369 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TCAIMQ66JZ4 499 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klhl5Q6PFE1 708 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Casp9Q8C3Q9 454 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ttc39cQ8VE09 580 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdhga6Q91XY2 932 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DeraQ91YP3 318 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmed11Q9D2R4 215 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nrg4Q9WTX4 115 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1480A0A140LIR8 359 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm20503G3UZK1 150 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MntO08789 591 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Btnl2O70355 454 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Enpp1P06802 906 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hoxc11P31313 304 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam169aQ5XG69 665 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pex11gQ6P6M5 241 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rxfp4Q7TQP4 414 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Svs2Q8BS30 375 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem135Q9CYV5 458 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 2610042L04RikQ9D073 150 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hddc3Q9D114 179 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4933425L06RikQ9D3Z8 585 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ndel1Q9ERR1 345 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ThadaA8C756 1938 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gp5O08742 567 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nudt2P56380 147 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hoxb13P70321 286 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ctps1P70698 591 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Inppl1Q6P549 1257 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nim1kQ8BHI9 436 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smoc2Q8CD91 447 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tma7Q8K003 64 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ints10Q8K2A7 710 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr807Q8VGI9 311 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DcxrQ91X52 244 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem246Q91YV9 403 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chid1Q922Q9 393 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpl17Q9CPR4 184 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ergic3Q9CQE7 383 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lrrc40Q9CRC8 602 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ndst3Q9EQH7 873 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tgm1Q9JLF6 815 aa15.85■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TrioQ0KL02 3102 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Faap100A2ACJ2 879 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam124aD3Z5V4 536 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2j8G3UZ38 503 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nrp2O35375 931 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Anxa6P14824 673 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdkn2bP55271 130 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hcrtr1P58307 416 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnab2P62482 367 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Myo1dQ5SYD0 1006 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ChpfQ6IQX7 774 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RbfaQ6P3B9 350 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usb1Q91W78 267 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp6ap2Q9CYN9 350 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sesn3Q9CYP7 492 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tchhl1Q9D3P1 638 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arpc5lQ9D898 153 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pik3cgQ9JHG7 1102 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mad2l1Q9Z1B5 205 aa15.84■□□□□ 0.13
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Myo10F8VQB6 2062 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.7 ms