RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027127.13

Sf3b1-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b1, Length 6,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Oser1Q9D722 291 aa8.37□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slfn3A0A1L1STQ7 640 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pate1E9Q658 125 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Itgb7P26011 806 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Htr7P32304 448 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gli1P47806 1111 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hpcal1P62748 193 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Trpv5P69744 723 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 CamkmtQ3U2J5 323 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Phf21aQ6ZPK0 659 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Adam29Q811Q4 763 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fbxo9Q8BK06 437 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1019Q8VGS3 310 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nt5c1bQ91YE9 573 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Q9CXL3 195 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mrpl45Q9D0Q7 306 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mcemp1Q9D8U6 183 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dusp6Q9DBB1 381 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cldn34b1B1AZQ8 209 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fam71e2L7N480 754 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cyp4a14O35728 507 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cyp2b19O55071 492 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Il6raP22272 460 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 RxrgP28705 463 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Anxa4P97429 319 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Emx2Q04744 253 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rab26Q504M8 260 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sfmbt2Q5DTW2 938 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fam189bQ5HZJ5 669 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 A4galtQ67BJ4 359 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 BegainQ68EF6 600 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Znf366Q6NS86 746 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Man1c1Q6NXK9 625 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ap1s3Q7TN05 154 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Timm29Q8BGX2 266 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pgs1Q8BHF7 553 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PisdQ8BSF4 406 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 GmppbQ8BTZ7 360 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Prmt5Q8CIG8 637 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sirt5Q8K2C6 310 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mtg1Q8R2R6 326 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gtf2h3Q8VD76 309 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pwp1Q99LL5 501 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cldn34b2Q9D9N2 209 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Il1rl2Q9ERS7 574 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Foxe3Q9QY14 288 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Spint1Q9R097 507 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm20431E9PY39 371 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zfp607bG3X9H3 648 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rpl3P27659 403 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 NadkP58058 439 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Adcyap1r1P70205 496 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 StimateQ3UF25 288 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hid1Q8R1F6 788 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 RragcQ99K70 398 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gbe1Q9D6Y9 702 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hipk3Q9ERH7 1192 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dnaja2Q9QYJ0 412 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn1r49Q9WUF1 310 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 HaspinQ9Z0R0 754 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Scn1aA2APX8 2009 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm13119B1ARV5 481 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn2r94E9PZK8 818 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zbtb10E9Q8X5 861 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Htr5bP31387 370 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Acvr1P37172 509 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Faf1P54731 649 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 AnpepP97449 966 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 S100gP97816 79 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Upf3aQ3ULJ3 422 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Plekha6Q7TQG1 1173 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mppe1Q80XL7 396 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pcdh20Q8BIZ0 952 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pgm2l1Q8CAA7 621 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc35a5Q921R7 437 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ankrd61Q9CQM6 421 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 ProzQ9CQW3 399 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Yae1d1Q9DAY6 216 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ifi30Q9ESY9 248 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Thsd7bQ6P4U0 1607 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 MipepA6H611 711 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hmgb3O54879 200 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tpst2O88856 376 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cd160O88875 185 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cyp1a1P00184 524 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lrrc3P59034 257 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pitx1P70314 315 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 NfycP70353 335 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cxcr5Q04683 374 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 H2-Q2Q4KN81 360 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm11992Q5SS90 291 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zpbp2Q6X786 326 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 DglucyQ8BH86 617 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PigwQ8C398 503 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Adamts2Q8C9W3 1213 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pi4k2bQ8CBQ5 469 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1310Q8VF85 312 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1302Q8VGE9 315 aa8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ubap2Q91VX2 1132 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zdhhc7Q91WU6 308 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.8 ms