RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 VIPP01282 170 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 IFNGP01579 166 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 OLR1P78380 273 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 BIKQ13323 160 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NAE1Q13564 534 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TAB1Q15750 504 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RAB30Q15771 203 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DGKKQ5KSL6 1271 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SERINC5Q86VE9 423 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 BTBD9Q96Q07 612 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RANBP9Q96S59 729 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 H0Y858 1186 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PI15O43692 258 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 OR10H3O60404 316 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF24P17028 368 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PTSQ03393 145 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LIPEQ05469 1076 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 C2orf80Q0P641 193 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 C11orf88Q6PI97 169 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM220Q6QAJ8 160 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 AP3S1Q92572 193 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TOP1MTQ969P6 601 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 APOLD1Q96LR9 279 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MIPEPQ99797 713 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NMUR1Q9HB89 426 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CD84Q9UIB8 345 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MYH4Q9Y623 1939 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MTMR11A4FU01 709 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 H7C0S8 307 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 FSHRP23945 695 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SLC11A1P49279 550 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ERVK-8P63133 956 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RING1Q06587 406 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CLEC6AQ6EIG7 209 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 SLC51AQ86UW1 340 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 OR10G6Q8NH81 332 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RAD51AP1Q96B01 352 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TRIB3Q96RU7 358 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GPR22Q99680 433 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DERL2Q9GZP9 239 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TMED5Q9Y3A6 229 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 H3BNX3 289 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 WNT9AO14904 365 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 OR4F21O95013 312 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFS1P28331 727 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 RABGGTBP53611 331 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TAS2R39P59534 338 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJB13P59910 316 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CHIT1Q13231 466 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 KCNC3Q14003 757 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PDGFRLQ15198 375 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MACC1Q6ZN28 852 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PQLC3Q8N755 202 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 AMER2Q8N7J2 671 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MTRRQ9UBK8 725 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 WWP2O00308 870 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF623O75123 536 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MFN2O95140 757 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 TCF4P15884 667 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 KHKP50053 298 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 CCR4P51679 360 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 AP1S2P56377 157 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 MTAPQ13126 283 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 GPM6BQ13491 265 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-228ENST00000636120 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms