RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 RRADP55042 308 aa26.7■■□□□ 1.86
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CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA22Q8NHS9 363 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 TLR10Q9BXR5 811 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A51Q9H1U9 297 aa26.7■■□□□ 1.86
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CAPNS1-217ENST00000629983 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
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CAPNS1-217ENST00000629983 DSELQ8IZU8 1212 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 IQCKQ8N0W5 287 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 C12orf66Q96MD2 445 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 C5orf34Q96MH7 638 aa26.69■■□□□ 1.86
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CAPNS1-217ENST00000629983 FAM8A1Q9UBU6 413 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP1A4Q13733 1029 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 LDLRAP1Q5SW96 308 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM151BQ6UXP7 276 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
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CAPNS1-217ENST00000629983 LRFN5Q96NI6 719 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 WWP1Q9H0M0 922 aa26.68■■□□□ 1.86
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CAPNS1-217ENST00000629983 SLC5A6Q9Y289 635 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A087X0T9 212 aa26.67■■□□□ 1.86
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CAPNS1-217ENST00000629983 GPR39O43194 453 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 UGT1A9O60656 530 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM228BP0C875 321 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 UGT1A6P19224 532 aa26.67■■□□□ 1.86
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CAPNS1-217ENST00000629983 PPM1MQ96MI6 270 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 UGT1A7Q9HAW7 530 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 UGT1A10Q9HAW8 530 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 UGT1A8Q9HAW9 530 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 IL26Q9NPH9 171 aa26.67■■□□□ 1.86
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CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 LCA5LO95447 670 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
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CAPNS1-217ENST00000629983 NOMO1Q15155 1222 aa26.66■■□□□ 1.86
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CAPNS1-217ENST00000629983 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
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CAPNS1-217ENST00000629983 SLC24A2Q9UI40 661 aa26.66■■□□□ 1.86
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CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GTH6 734 aa26.65■■□□□ 1.86
CAPNS1-217ENST00000629983 SMTNL1A8MU46 457 aa26.65■■□□□ 1.86
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CAPNS1-217ENST00000629983 SERPING1P05155 500 aa26.65■■□□□ 1.86
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