RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 GLYATQ6IB77 296 aa9.48□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC8B1Q6J4K2 584 aa9.48□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC2A7Q6PXP3 512 aa9.48□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.48□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 FNDC5Q8NAU1 212 aa9.48□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 OR52E4Q8NGH9 312 aa9.48□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 H0Y858 1186 aa9.47□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC28A1O00337 649 aa9.47□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 GFRA2O00451 464 aa9.47□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 TAPBPO15533 448 aa9.47□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 RAP2AP10114 183 aa9.47□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 TTC23LQ6PF05 361 aa9.47□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.47□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.47□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 OR4F6Q8NGB9 312 aa9.47□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.47□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM9Q9P0T7 183 aa9.47□□□□□ -0.89
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IGHV3-54-201ENST00000622166 USP22Q9UPT9 525 aa9.47□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PKP3Q9Y446 797 aa9.47□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa9.47□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 OARD1Q9Y530 152 aa9.47□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.47□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR51B4Q9Y5P0 310 aa9.47□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa9.46□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 CROCCQ5TZA2 2017 aa9.46□□□□□ -0.89
IGHV3-54-201ENST00000622166 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
IGHV3-54-201ENST00000622166 FFAR2O15552 330 aa9.46□□□□□ -0.9
IGHV3-54-201ENST00000622166 NBNO60934 754 aa9.46□□□□□ -0.9
IGHV3-54-201ENST00000622166 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
IGHV3-54-201ENST00000622166 SCELO95171 688 aa9.46□□□□□ -0.9
IGHV3-54-201ENST00000622166 PGLSO95336 258 aa9.46□□□□□ -0.9
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