RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 UGT1A6P19224 532 aa21.59■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 UGT1A1P22309 533 aa21.59■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 UGT1A4P22310 534 aa21.59■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 CTNNA2P26232 953 aa21.59■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 ADRA1AP35348 466 aa21.59■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 ATP5OP48047 213 aa21.59■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 RANBP10Q6VN20 620 aa21.59■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 AMZ2Q86W34 360 aa21.59■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 CXorf40BQ96DE9 158 aa21.59■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 OSBPL8Q9BZF1 889 aa21.59■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 UGT1A7Q9HAW7 530 aa21.59■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 UGT1A10Q9HAW8 530 aa21.59■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 UGT1A8Q9HAW9 530 aa21.59■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 CCDC66A2RUB6 948 aa21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 BUD23O43709 281 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 PRAMEF1O95521 474 aa21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 AMD1P17707 334 aa21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 HALP42357 657 aa21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 ZNF75DP51815 510 aa21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 MLLT10P55197 1068 aa21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 TMTC1Q8IUR5 882 aa21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 GPR150Q8NGU9 434 aa21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 TGM7Q96PF1 710 aa21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 C19orf43Q9BQ61 176 aa21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 FERMT1Q9BQL6 677 aa21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 FICDQ9BVA6 458 aa21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 C10orf88Q9H8K7 445 aa21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 SEMA5BQ9P283 1151 aa21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 POLHQ9Y253 713 aa21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 ARL5AQ9Y689 179 aa21.58■■□□□ 1.05
SRRT-218ENST00000620394 MYO9AB2RTY4 2548 aa21.57■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 STX7O15400 261 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 POP7O75817 140 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 AGTP01019 485 aa21.57■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 NR1D1P20393 614 aa21.57■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa21.57■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 CCDC181Q5TID7 509 aa21.57■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa21.57■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa21.57■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 LRRC57Q8N9N7 239 aa21.57■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 KLHL6Q8WZ60 621 aa21.57■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 ULBP3Q9BZM4 244 aa21.57■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 OR2AG2A6NM03 316 aa21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 AGAP14A8MT82 685 aa21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 RFPL1O75677 317 aa21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 AGFG2O95081 481 aa21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 RBP3P10745 1247 aa21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 LPOP22079 712 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 PSMB4P28070 264 aa21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 DLSTP36957 453 aa21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 PTPRCAPQ14761 206 aa21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 RPE65Q16518 533 aa21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 LONRF2Q1L5Z9 754 aa21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 ASB18Q6ZVZ8 466 aa21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 ZNF398Q8TD17 642 aa21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 ALG3Q92685 438 aa21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 SPATA13Q96N96 652 aa21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 TRIM10Q9UDY6 481 aa21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 DUSP10Q9Y6W6 482 aa21.56■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 MACROD2A1Z1Q3 448 aa21.55■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 KLHL33A6NCF5 533 aa21.55■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 C5orf60A6NFR6 353 aa21.55■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 VPS4BO75351 444 aa21.55■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 RWDD2BP57060 319 aa21.55■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 SH3BP2P78314 561 aa21.55■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 NFE2L1Q14494 772 aa21.55■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 IL11RAQ14626 422 aa21.55■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 FHL5Q5TD97 284 aa21.55■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 METRNLQ641Q3 311 aa21.55■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 TMEM220Q6QAJ8 160 aa21.55■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 RAD9BQ6WBX8 426 aa21.55■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 ZDHHC12Q96GR4 267 aa21.55■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa21.55■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 LACRTQ9GZZ8 138 aa21.55■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 VPS4AQ9UN37 437 aa21.55■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 NOTCH2Q04721 2471 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 UNC79Q9P2D8 2635 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 GRID2IPA4D2P6 1211 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 C2orf81A6NN90 581 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 K7EM74 188 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 KCNN4O15554 427 aa21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 SRP72O76094 671 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SRRT-218ENST00000620394 STK10O94804 968 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
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