RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 WASH2PQ6VEQ5 465 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 P4HA3Q7Z4N8 544 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 IQCHQ86VS3 1027 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 KERAO60938 352 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 MT-ND1P03886 318 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 FUT4P22083 530 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 RPL22P35268 128 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 BST1Q10588 318 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 FIGNQ5HY92 759 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 BRMS1LQ5PSV4 323 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 MOXD1Q6UVY6 613 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 OR6K2Q8NGY2 324 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 SUN3Q8TAQ9 357 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 STRA6Q9BX79 667 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 COL6A1P12109 1028 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 CREB5Q02930 508 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 IKBKEQ14164 716 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 CFAP52Q8N1V2 620 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 PFDN5Q99471 154 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC5A7Q9GZV3 580 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC22A4Q9H015 551 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRA2Q9H9E1 313 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 MAPTP10636 758 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 CERCAMQ5T4B2 595 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM13CQ8NE31 585 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 DNERQ8NFT8 737 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 S100A14Q9HCY8 104 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 FBXW2Q9UKT8 454 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF726A6NNF4 738 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF311Q5JNZ3 666 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 ADH1CP00326 375 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 TACSTD2P09758 323 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 GOT1P17174 413 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 MAGEA6P43360 314 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 SGCBQ16585 318 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 CEP97Q8IW35 865 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 DAGLBQ8NCG7 672 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 ISCA1Q9BUE6 129 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 PNPOQ9NVS9 261 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 CTDNEP1O95476 244 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 GLRA2P23416 452 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 TROAPQ12815 778 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 KCT2Q8NC54 265 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 GIN1Q9NXP7 522 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 ERVK-18Q9QC07 812 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 GRIN2DO15399 1336 aa18.39■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 IQCF5A8MTL0 148 aa18.39■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 ADAM15Q13444 863 aa18.39■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 KLHL22Q53GT1 634 aa18.39■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC16A9Q7RTY1 509 aa18.39■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 KLHL15Q96M94 604 aa18.39■□□□□ 0.54
PTPRJ-207ENST00000613246 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 VIPP01282 170 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 MSX1P28360 303 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 GABRB2P47870 512 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 C6orf183Q5T699 404 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 DUPD1Q68J44 220 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 PAQR7Q86WK9 346 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 C4orf19Q8IY42 314 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 GALNT15Q8N3T1 639 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 IFT27Q9BW83 186 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 EBPLQ9BY08 206 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 VNN3Q9NY84 501 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 TESMINQ9Y4I5 508 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 H3BSH0 61 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 IFNW1P05000 195 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC8B1Q6J4K2 584 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 ASB18Q6ZVZ8 466 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 GLI2P10070 1586 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 NFASCO94856 1347 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 WFS1O76024 890 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 TIE1P35590 1138 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 TIGD2Q4W5G0 525 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 RNF220Q5VTB9 566 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 WSCD1Q658N2 575 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 GPR139Q6DWJ6 353 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 ABHD5Q8WTS1 349 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 NSMCE3Q96MG7 304 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 USP20Q9Y2K6 914 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 ADAMDEC1O15204 470 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 WSCD2Q2TBF2 565 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD46Q86W74 232 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRN4Q8WUT4 740 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 TM9SF3Q9HD45 589 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
PTPRJ-207ENST00000613246 hCG_2039718K7EN88 272 aa18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms