RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589753.1

ATG4D-211, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 931 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-211ENST00000589753 MED16Q9Y2X0 877 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 PCDH15Q96QU1 1955 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 A0A1B0GTQ1 180 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 TLDC2A0PJX2 215 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 HMX2A2RU54 273 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 PROB1E7EW31 1015 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 CDH16O75309 829 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 ENGP17813 658 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 AOAHP28039 575 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 RXRGP48443 463 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 CLCN7P51798 805 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 TAS2R39P59534 338 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 ZNF844Q08AG5 666 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 DMPKQ09013 629 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 SPEM2Q0P670 501 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 C1orf61Q13536 156 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 NFE2L1Q14494 772 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 RASA2Q15283 850 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 TMED2Q15363 201 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 ELOCQ15369 112 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 TCEA2Q15560 299 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 SYTL3Q4VX76 610 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 NAPRTQ6XQN6 538 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 HDXQ7Z353 690 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 CFAP206Q8IYR0 622 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 ZBTB2Q8N680 514 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 CCL4L1Q8NHW4 92 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 GPBAR1Q8TDU6 330 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 LMX1AQ8TE12 382 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 ASZ1Q8WWH4 475 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 MTBPQ96DY7 904 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 TSPAN17Q96FV3 270 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 COG4Q9H9E3 785 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 GALPQ9UBC7 116 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 GULP1Q9UBP9 304 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 TBK1Q9UHD2 729 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 ST14Q9Y5Y6 855 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 TRIM49D1C9J1S8 452 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 YKT6O15498 198 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 AQP9O43315 295 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 SDC3O75056 442 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 LRP3O75074 770 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 PIAS2O75928 621 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 APOA4P06727 396 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 STMN1P16949 149 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 AK4P27144 223 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 ACTR1BP42025 376 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 CLCNKAP51800 687 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 ACTR1AP61163 376 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 SHBQ15464 509 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 CROCCP2Q86T23 111 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 PIM3Q86V86 326 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 NRROSQ86YC3 692 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 CEP97Q8IW35 865 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 CD200R1Q8TD46 325 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 ANKRD7Q92527 254 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 INPP5DQ92835 1189 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 TMEM159Q96B96 161 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 SLC30A3Q99726 388 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 IL21RQ9HBE5 538 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 EURLQ9NYK6 297 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 DHRS7Q9Y394 339 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 GON4LQ3T8J9 2241 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 TMEM131Q92545 1883 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4D-211ENST00000589753 WDFY4Q6ZS81 3184 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-211ENST00000589753 SDK1Q7Z5N4 2213 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-211ENST00000589753 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-211ENST00000589753 LNP1A1A4G5 178 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-211ENST00000589753 PRR19A6NJB7 356 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-211ENST00000589753 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ATG4D-211ENST00000589753 IDSP22304 550 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms