RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586397.5

PRKAR1A-211, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKAR1A, Length 1,940 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-211ENST00000586397 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.023e-8■■□□□ 13.8
PRKAR1A-211ENST00000586397 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 LRRC32Q14392 662 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 BCL7AQ4VC05 210 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 CFAP157Q5JU67 520 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 SEL1L3Q68CR1 1132 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 NEK5Q6P3R8 708 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR14C36Q8NHC7 312 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 C10orf82Q8WW14 230 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 EXT2Q93063 718 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 PHF21BQ96EK2 531 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 CNDP1Q96KN2 507 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 SH3GL3Q99963 347 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRMOQ9BU70 441 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 HAO1Q9UJM8 370 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 IKZF3Q9UKT9 509 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 USH1CQ9Y6N9 552 aa8.69□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR2AG2A6NM03 316 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 STX16O14662 325 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 VEGFDO43915 354 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 KLK8O60259 260 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 NUAK1O60285 661 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 CDK14O94921 469 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 PCCBP05166 539 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 CHRNB1P11230 501 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 IMPDH1P20839 514 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 HK2P52789 917 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 CTSCP53634 463 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 NAA20P61599 178 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 HERVK_113P63132 956 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZP2Q05996 745 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 GTF2H3Q13889 308 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 PPP1R3AQ16821 1122 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 WSCD2Q2TBF2 565 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 PNCKQ6P2M8 343 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 SBSNQ6UWP8 590 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 FRA10AC1Q70Z53 315 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 GPSM1Q86YR5 675 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 FBXO39Q8N4B4 442 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 CCNYL1Q8N7R7 359 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 RFWD2Q8NHY2 731 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 ASZ1Q8WWH4 475 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 COX14Q96I36 57 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 HIC2Q96JB3 615 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 ERVK-6Q9BXR3 956 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 NUDT4Q9NZJ9 180 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 CA14Q9ULX7 337 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 RAP2CQ9Y3L5 183 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 A0A0G2JND7 137 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 A0A1W2PQU0 124 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 RAD51BO15315 384 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 CHRNGP07510 517 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 GSTM1P09488 218 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 DGKEP52429 567 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 GSTM4Q03013 218 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 HSPA14Q0VDF9 509 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 PRKAA1Q13131 559 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 SGCGQ13326 291 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 TGFBIQ15582 683 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 PFKFB4Q16877 469 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF678Q5SXM1 525 aa8.68□□□□□ -1.02
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms