RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	BGN	P21810	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	LMO2	P25791	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CRABP2	P29373	138 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CCR1	P32246	355 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ELF1	P32519	619 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PGM1	P36871	562 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC1A6	P48664	564 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RENBP	P51606	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RAP1GDS1	P52306	607 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GEM	P55040	296 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SCAND1	P57086	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DAOA	P59103	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NAA20	P61599	178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNJ2	P63252	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PPARD	Q03181	441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MGAT2	Q10469	447 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GALNT2	Q10471	571 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SREBF2	Q12772	1141 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SMARCB1	Q12824	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NME3	Q13232	169 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DPYS	Q14117	519 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CHI3L2	Q15782	390 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC6	Q16204	474 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CA9	Q16790	459 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	WSCD1	Q658N2	575 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289		Q6ZNX1	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM131B	Q86XD5	332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF567	Q8N184	647 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC185	Q8N715	623 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	AGAP11	Q8TF27	550 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PEX13	Q92968	403 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CERS2	Q96G23	380 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FAR2	Q96K12	515 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	LGMN	Q99538	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GBA3	Q9H227	469 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	VCX	Q9H320	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DDIT4	Q9NX09	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289		A0A0U1RQF3	1178 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289		M0QZQ0	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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