RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575857.3

SLC12A4-215, Transcript of solute carrier family 12 member 4, human

TSL 3

Gene SLC12A4, Length 588 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC12A4-215	ENST00000575857	SFRP1	Q8N474	314 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	OR2L2	Q8NH16	312 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	LPGAT1	Q92604	370 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	TCF12	Q99081	682 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	PADI4	Q9UM07	663 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	KLHL33	A6NCF5	533 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	S1PR4	O95977	384 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	ERVK-10	P10266	1014 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	F3	P13726	295 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	SLC1A2	P43004	574 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	DAB2	P98082	770 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	ILK	Q13418	452 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	METRNL	Q641Q3	311 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	KCNMB4	Q86W47	210 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	ARL14	Q8N4G2	192 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	HM13	Q8TCT9	377 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	GLMN	Q92990	594 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	CERS2	Q96G23	380 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	BIRC8	Q96P09	236 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	TTC1	Q99614	292 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	ATRX	P46100	2492 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	ITPR1	Q14643	2758 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	LAMA5	O15230	3695 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	QSOX1	O00391	747 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	SNX2	O60749	519 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	NDUFS3	O75489	264 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	C1QA	P02745	245 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	GP1BA	P07359	652 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	GSTM1	P09488	218 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	OR56A5	P0C7T3	313 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	GLB1	P16278	677 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	VCL	P18206	1134 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	IDS	P22304	550 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	GABRB3	P28472	473 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	FASLG	P48023	281 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	RPIA	P49247	311 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	MPP1	Q00013	466 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	GSTM4	Q03013	218 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	CTBP1	Q13363	440 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	NR1D2	Q14995	579 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	CLCA4	Q14CN2	919 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	PERM1	Q5SV97	790 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	LRRC6	Q86X45	466 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	PROSER1	Q86XN7	944 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	IFI44	Q8TCB0	444 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	CFAP36	Q96G28	342 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SLC12A4-215	ENST00000575857	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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