RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572656.2

TRAPPC1-205, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC1, Length 409 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-205ENST00000572656 OR2AG2A6NM03 316 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 UGT1A9O60656 530 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 DPM1O60762 260 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 EPOP01588 193 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 RAB40ALP0C0E4 278 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 UGT1A6P19224 532 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 UGT1A1P22309 533 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 UGT1A4P22310 534 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 PTPN3P26045 913 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 SPAM1P38567 509 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 PTGIRP43119 386 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 WNT3AP56704 352 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 UBASH3AP57075 661 aa9.63□□□□□ -0.87
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TRAPPC1-205ENST00000572656 FANCCQ00597 558 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 GPS2Q13227 327 aa9.63□□□□□ -0.87
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TRAPPC1-205ENST00000572656 NFE2L1Q14494 772 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 MESDQ14696 234 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
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TRAPPC1-205ENST00000572656 SLC18A3Q16572 532 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 SIRPB2Q5JXA9 342 aa9.63□□□□□ -0.87
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TRAPPC1-205ENST00000572656 TMTC4Q5T4D3 741 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 ARMC6Q6NXE6 501 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
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TRAPPC1-205ENST00000572656 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.63□□□□□ -0.87
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TRAPPC1-205ENST00000572656 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 SLC38A9Q8NBW4 561 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
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TRAPPC1-205ENST00000572656 UGT1A8Q9HAW9 530 aa9.63□□□□□ -0.87
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TRAPPC1-205ENST00000572656 NOMO1Q15155 1222 aa9.62□□□□□ -0.87
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TRAPPC1-205ENST00000572656 SNX7Q9UNH6 387 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 BTRCQ9Y297 605 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 PKP3Q9Y446 797 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC1-205ENST00000572656 KRT1P04264 644 aa9.61□□□□□ -0.87
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